Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Sh3bp5Q9Z131 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Sh3bp5Q9Z131 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Sh3bp5Q9Z131 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Sh3bp5Q9Z131 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Sh3bp5Q9Z131 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Sh3bp5Q9Z131 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Sh3bp5Q9Z131 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Sh3bp5Q9Z131 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,21■■■■□ 3,07
Sh3bp5Q9Z131 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Sh3bp5Q9Z131 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Sh3bp5Q9Z131 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Sh3bp5Q9Z131 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Sh3bp5Q9Z131 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Sh3bp5Q9Z131 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Sh3bp5Q9Z131 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Sh3bp5Q9Z131 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Sh3bp5Q9Z131 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,95■■■■□ 3,03
Sh3bp5Q9Z131 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,95■■■■□ 3,02
Sh3bp5Q9Z131 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Sh3bp5Q9Z131 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Sh3bp5Q9Z131 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Sh3bp5Q9Z131 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Sh3bp5Q9Z131 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Sh3bp5Q9Z131 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Sh3bp5Q9Z131 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Sh3bp5Q9Z131 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Sh3bp5Q9Z131 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Sh3bp5Q9Z131 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Sh3bp5Q9Z131 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Sh3bp5Q9Z131 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Sh3bp5Q9Z131 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Sh3bp5Q9Z131 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Sh3bp5Q9Z131 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Sh3bp5Q9Z131 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sh3bp5Q9Z131 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Sh3bp5Q9Z131 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Sh3bp5Q9Z131 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Sh3bp5Q9Z131 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Sh3bp5Q9Z131 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Sh3bp5Q9Z131 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Sh3bp5Q9Z131 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Sh3bp5Q9Z131 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Sh3bp5Q9Z131 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,39■■■□□ 2,94
Sh3bp5Q9Z131 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Sh3bp5Q9Z131 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Sh3bp5Q9Z131 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Sh3bp5Q9Z131 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Sh3bp5Q9Z131 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Sh3bp5Q9Z131 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Sh3bp5Q9Z131 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Sh3bp5Q9Z131 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,25■■■□□ 2,91
Sh3bp5Q9Z131 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Sh3bp5Q9Z131 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Sh3bp5Q9Z131 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Sh3bp5Q9Z131 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Sh3bp5Q9Z131 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Sh3bp5Q9Z131 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sh3bp5Q9Z131 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Sh3bp5Q9Z131 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Sh3bp5Q9Z131 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Sh3bp5Q9Z131 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Sh3bp5Q9Z131 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Sh3bp5Q9Z131 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Sh3bp5Q9Z131 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sh3bp5Q9Z131 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Sh3bp5Q9Z131 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Sh3bp5Q9Z131 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Sh3bp5Q9Z131 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Sh3bp5Q9Z131 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Sh3bp5Q9Z131 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Sh3bp5Q9Z131 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Sh3bp5Q9Z131 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Sh3bp5Q9Z131 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,51■■■□□ 2,8
Sh3bp5Q9Z131 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Sh3bp5Q9Z131 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms