Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z117

Zfp53, KRAB-containing zinc-finger protein KRAZ1, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp53Q9Z117 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Zfp53Q9Z117 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Zfp53Q9Z117 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Zfp53Q9Z117 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Zfp53Q9Z117 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Zfp53Q9Z117 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Zfp53Q9Z117 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Zfp53Q9Z117 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Zfp53Q9Z117 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Zfp53Q9Z117 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Zfp53Q9Z117 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Zfp53Q9Z117 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
Zfp53Q9Z117 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Zfp53Q9Z117 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Zfp53Q9Z117 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Zfp53Q9Z117 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Zfp53Q9Z117 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,88■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Zfp53Q9Z117 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Zfp53Q9Z117 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Zfp53Q9Z117 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Zfp53Q9Z117 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Zfp53Q9Z117 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Zfp53Q9Z117 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Zfp53Q9Z117 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Zfp53Q9Z117 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Zfp53Q9Z117 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Zfp53Q9Z117 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Zfp53Q9Z117 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Zfp53Q9Z117 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Zfp53Q9Z117 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Zfp53Q9Z117 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Zfp53Q9Z117 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Zfp53Q9Z117 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Zfp53Q9Z117 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Zfp53Q9Z117 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Zfp53Q9Z117 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Zfp53Q9Z117 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Zfp53Q9Z117 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,6■■□□□ 1,05
Zfp53Q9Z117 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Zfp53Q9Z117 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Zfp53Q9Z117 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Zfp53Q9Z117 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Zfp53Q9Z117 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Zfp53Q9Z117 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Zfp53Q9Z117 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Zfp53Q9Z117 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Zfp53Q9Z117 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Zfp53Q9Z117 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Zfp53Q9Z117 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,4■■□□□ 1,02
Zfp53Q9Z117 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Zfp53Q9Z117 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,31■■□□□ 1
Zfp53Q9Z117 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Zfp53Q9Z117 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Zfp53Q9Z117 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Zfp53Q9Z117 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Zfp53Q9Z117 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Zfp53Q9Z117 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Zfp53Q9Z117 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,21■□□□□ 0,99
Zfp53Q9Z117 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Zfp53Q9Z117 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Zfp53Q9Z117 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Zfp53Q9Z117 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Zfp53Q9Z117 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Zfp53Q9Z117 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Zfp53Q9Z117 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21,16■□□□□ 0,98
Zfp53Q9Z117 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Zfp53Q9Z117 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Zfp53Q9Z117 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Zfp53Q9Z117 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Zfp53Q9Z117 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Zfp53Q9Z117 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Zfp53Q9Z117 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Zfp53Q9Z117 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,07■□□□□ 0,96
Zfp53Q9Z117 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Zfp53Q9Z117 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Zfp53Q9Z117 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms