Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Itgb6Q9Z0T9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Itgb6Q9Z0T9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Itgb6Q9Z0T9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Itgb6Q9Z0T9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Itgb6Q9Z0T9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Itgb6Q9Z0T9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Itgb6Q9Z0T9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Itgb6Q9Z0T9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Itgb6Q9Z0T9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Itgb6Q9Z0T9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Itgb6Q9Z0T9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Itgb6Q9Z0T9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Itgb6Q9Z0T9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Itgb6Q9Z0T9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Itgb6Q9Z0T9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Itgb6Q9Z0T9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Itgb6Q9Z0T9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Itgb6Q9Z0T9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Itgb6Q9Z0T9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Itgb6Q9Z0T9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Itgb6Q9Z0T9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Itgb6Q9Z0T9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Itgb6Q9Z0T9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Itgb6Q9Z0T9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Itgb6Q9Z0T9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Itgb6Q9Z0T9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Itgb6Q9Z0T9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itgb6Q9Z0T9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itgb6Q9Z0T9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Itgb6Q9Z0T9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Itgb6Q9Z0T9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Itgb6Q9Z0T9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Itgb6Q9Z0T9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Itgb6Q9Z0T9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Itgb6Q9Z0T9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Itgb6Q9Z0T9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Itgb6Q9Z0T9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Itgb6Q9Z0T9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Itgb6Q9Z0T9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Itgb6Q9Z0T9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Itgb6Q9Z0T9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Itgb6Q9Z0T9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Itgb6Q9Z0T9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Itgb6Q9Z0T9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Itgb6Q9Z0T9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
Itgb6Q9Z0T9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Itgb6Q9Z0T9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Itgb6Q9Z0T9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Itgb6Q9Z0T9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Itgb6Q9Z0T9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Itgb6Q9Z0T9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Itgb6Q9Z0T9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Itgb6Q9Z0T9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Itgb6Q9Z0T9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Itgb6Q9Z0T9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,59■■□□□ 1,69
Itgb6Q9Z0T9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Itgb6Q9Z0T9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Itgb6Q9Z0T9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Itgb6Q9Z0T9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Itgb6Q9Z0T9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Itgb6Q9Z0T9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Itgb6Q9Z0T9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itgb6Q9Z0T9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Itgb6Q9Z0T9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Itgb6Q9Z0T9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Itgb6Q9Z0T9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itgb6Q9Z0T9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Itgb6Q9Z0T9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Itgb6Q9Z0T9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itgb6Q9Z0T9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itgb6Q9Z0T9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Itgb6Q9Z0T9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Itgb6Q9Z0T9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgb6Q9Z0T9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itgb6Q9Z0T9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itgb6Q9Z0T9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Itgb6Q9Z0T9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Itgb6Q9Z0T9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Itgb6Q9Z0T9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Itgb6Q9Z0T9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Itgb6Q9Z0T9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Itgb6Q9Z0T9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Itgb6Q9Z0T9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Itgb6Q9Z0T9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Itgb6Q9Z0T9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Itgb6Q9Z0T9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Itgb6Q9Z0T9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Itgb6Q9Z0T9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Itgb6Q9Z0T9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Itgb6Q9Z0T9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Itgb6Q9Z0T9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Itgb6Q9Z0T9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Itgb6Q9Z0T9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Itgb6Q9Z0T9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Itgb6Q9Z0T9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Itgb6Q9Z0T9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,98■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms