Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0P4

Palm, Paralemmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalmQ9Z0P4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
PalmQ9Z0P4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC37■■■■□ 3,51
PalmQ9Z0P4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
PalmQ9Z0P4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,96■■■■□ 3,51
PalmQ9Z0P4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36,95■■■■□ 3,51
PalmQ9Z0P4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,91■■■■□ 3,5
PalmQ9Z0P4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
PalmQ9Z0P4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
PalmQ9Z0P4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
PalmQ9Z0P4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,5
PalmQ9Z0P4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
PalmQ9Z0P4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,79■■■■□ 3,48
PalmQ9Z0P4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
PalmQ9Z0P4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
PalmQ9Z0P4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36,78■■■■□ 3,48
PalmQ9Z0P4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
PalmQ9Z0P4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,71■■■■□ 3,47
PalmQ9Z0P4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
PalmQ9Z0P4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36,63■■■■□ 3,45
PalmQ9Z0P4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
PalmQ9Z0P4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,58■■■■□ 3,45
PalmQ9Z0P4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,58■■■■□ 3,45
PalmQ9Z0P4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
PalmQ9Z0P4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
PalmQ9Z0P4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
PalmQ9Z0P4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
PalmQ9Z0P4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,37■■■■□ 3,41
PalmQ9Z0P4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
PalmQ9Z0P4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,36■■■■□ 3,41
PalmQ9Z0P4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
PalmQ9Z0P4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
PalmQ9Z0P4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36,26■■■■□ 3,4
PalmQ9Z0P4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,25■■■■□ 3,39
PalmQ9Z0P4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
PalmQ9Z0P4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
PalmQ9Z0P4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36,11■■■■□ 3,37
PalmQ9Z0P4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
PalmQ9Z0P4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
PalmQ9Z0P4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
PalmQ9Z0P4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
PalmQ9Z0P4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
PalmQ9Z0P4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
PalmQ9Z0P4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
PalmQ9Z0P4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
PalmQ9Z0P4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35,99■■■■□ 3,35
PalmQ9Z0P4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
PalmQ9Z0P4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
PalmQ9Z0P4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
PalmQ9Z0P4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
PalmQ9Z0P4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,82■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35,8■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,79■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,77■■■■□ 3,32
PalmQ9Z0P4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35,76■■■■□ 3,31
PalmQ9Z0P4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,74■■■■□ 3,31
PalmQ9Z0P4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,7■■■■□ 3,31
PalmQ9Z0P4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
PalmQ9Z0P4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
PalmQ9Z0P4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
PalmQ9Z0P4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
PalmQ9Z0P4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,4■■■■□ 3,26
PalmQ9Z0P4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
PalmQ9Z0P4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
PalmQ9Z0P4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
PalmQ9Z0P4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
PalmQ9Z0P4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35,27■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,24
PalmQ9Z0P4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
PalmQ9Z0P4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
PalmQ9Z0P4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
PalmQ9Z0P4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
PalmQ9Z0P4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
PalmQ9Z0P4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
PalmQ9Z0P4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
PalmQ9Z0P4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
PalmQ9Z0P4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
PalmQ9Z0P4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
PalmQ9Z0P4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
PalmQ9Z0P4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
PalmQ9Z0P4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
PalmQ9Z0P4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34,99■■■■□ 3,19
PalmQ9Z0P4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
PalmQ9Z0P4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
PalmQ9Z0P4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
PalmQ9Z0P4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
PalmQ9Z0P4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57,2 ms