Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Katna1Q9WV86 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Katna1Q9WV86 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Katna1Q9WV86 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Katna1Q9WV86 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Katna1Q9WV86 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Katna1Q9WV86 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Katna1Q9WV86 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Katna1Q9WV86 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Katna1Q9WV86 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Katna1Q9WV86 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Katna1Q9WV86 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Katna1Q9WV86 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Katna1Q9WV86 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Katna1Q9WV86 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Katna1Q9WV86 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Katna1Q9WV86 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Katna1Q9WV86 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Katna1Q9WV86 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Katna1Q9WV86 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Katna1Q9WV86 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Katna1Q9WV86 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Katna1Q9WV86 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Katna1Q9WV86 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Katna1Q9WV86 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Katna1Q9WV86 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Katna1Q9WV86 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Katna1Q9WV86 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Katna1Q9WV86 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Katna1Q9WV86 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Katna1Q9WV86 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Katna1Q9WV86 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Katna1Q9WV86 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Katna1Q9WV86 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Katna1Q9WV86 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Katna1Q9WV86 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Katna1Q9WV86 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Katna1Q9WV86 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Katna1Q9WV86 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Katna1Q9WV86 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Katna1Q9WV86 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Katna1Q9WV86 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Katna1Q9WV86 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Katna1Q9WV86 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Katna1Q9WV86 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Katna1Q9WV86 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Katna1Q9WV86 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Katna1Q9WV86 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Katna1Q9WV86 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Katna1Q9WV86 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Katna1Q9WV86 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Katna1Q9WV86 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Katna1Q9WV86 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Katna1Q9WV86 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Katna1Q9WV86 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Katna1Q9WV86 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Katna1Q9WV86 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Katna1Q9WV86 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Katna1Q9WV86 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Katna1Q9WV86 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Katna1Q9WV86 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Katna1Q9WV86 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Katna1Q9WV86 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Katna1Q9WV86 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Katna1Q9WV86 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Katna1Q9WV86 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Katna1Q9WV86 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Katna1Q9WV86 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Katna1Q9WV86 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Katna1Q9WV86 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Katna1Q9WV86 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Katna1Q9WV86 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Katna1Q9WV86 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Katna1Q9WV86 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Katna1Q9WV86 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Katna1Q9WV86 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Katna1Q9WV86 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Katna1Q9WV86 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Katna1Q9WV86 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Katna1Q9WV86 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Katna1Q9WV86 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Katna1Q9WV86 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Katna1Q9WV86 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Katna1Q9WV86 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Katna1Q9WV86 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms