Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arpc1bQ9WV32 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arpc1bQ9WV32 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arpc1bQ9WV32 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arpc1bQ9WV32 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arpc1bQ9WV32 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arpc1bQ9WV32 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arpc1bQ9WV32 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arpc1bQ9WV32 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arpc1bQ9WV32 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arpc1bQ9WV32 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arpc1bQ9WV32 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arpc1bQ9WV32 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arpc1bQ9WV32 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arpc1bQ9WV32 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arpc1bQ9WV32 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arpc1bQ9WV32 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arpc1bQ9WV32 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arpc1bQ9WV32 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arpc1bQ9WV32 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arpc1bQ9WV32 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arpc1bQ9WV32 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arpc1bQ9WV32 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arpc1bQ9WV32 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arpc1bQ9WV32 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arpc1bQ9WV32 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arpc1bQ9WV32 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arpc1bQ9WV32 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arpc1bQ9WV32 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arpc1bQ9WV32 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arpc1bQ9WV32 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arpc1bQ9WV32 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arpc1bQ9WV32 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arpc1bQ9WV32 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arpc1bQ9WV32 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arpc1bQ9WV32 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arpc1bQ9WV32 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arpc1bQ9WV32 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arpc1bQ9WV32 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arpc1bQ9WV32 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Arpc1bQ9WV32 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Arpc1bQ9WV32 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arpc1bQ9WV32 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arpc1bQ9WV32 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arpc1bQ9WV32 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arpc1bQ9WV32 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arpc1bQ9WV32 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arpc1bQ9WV32 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arpc1bQ9WV32 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arpc1bQ9WV32 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arpc1bQ9WV32 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arpc1bQ9WV32 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arpc1bQ9WV32 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arpc1bQ9WV32 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arpc1bQ9WV32 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arpc1bQ9WV32 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arpc1bQ9WV32 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arpc1bQ9WV32 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Arpc1bQ9WV32 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arpc1bQ9WV32 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arpc1bQ9WV32 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arpc1bQ9WV32 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arpc1bQ9WV32 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arpc1bQ9WV32 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Arpc1bQ9WV32 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Arpc1bQ9WV32 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms