Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Gabbr1Q9WV18 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Gabbr1Q9WV18 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Gabbr1Q9WV18 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Gabbr1Q9WV18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Gabbr1Q9WV18 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Gabbr1Q9WV18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Gabbr1Q9WV18 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Gabbr1Q9WV18 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Gabbr1Q9WV18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Gabbr1Q9WV18 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Gabbr1Q9WV18 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Gabbr1Q9WV18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gabbr1Q9WV18 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Gabbr1Q9WV18 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Gabbr1Q9WV18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gabbr1Q9WV18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gabbr1Q9WV18 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Gabbr1Q9WV18 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gabbr1Q9WV18 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gabbr1Q9WV18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gabbr1Q9WV18 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gabbr1Q9WV18 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gabbr1Q9WV18 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gabbr1Q9WV18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gabbr1Q9WV18 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gabbr1Q9WV18 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gabbr1Q9WV18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gabbr1Q9WV18 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gabbr1Q9WV18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Gabbr1Q9WV18 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gabbr1Q9WV18 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gabbr1Q9WV18 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gabbr1Q9WV18 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Gabbr1Q9WV18 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gabbr1Q9WV18 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gabbr1Q9WV18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gabbr1Q9WV18 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Gabbr1Q9WV18 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gabbr1Q9WV18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Gabbr1Q9WV18 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gabbr1Q9WV18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gabbr1Q9WV18 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gabbr1Q9WV18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Gabbr1Q9WV18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Gabbr1Q9WV18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Gabbr1Q9WV18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Gabbr1Q9WV18 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gabbr1Q9WV18 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gabbr1Q9WV18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gabbr1Q9WV18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gabbr1Q9WV18 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gabbr1Q9WV18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gabbr1Q9WV18 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gabbr1Q9WV18 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gabbr1Q9WV18 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Gabbr1Q9WV18 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gabbr1Q9WV18 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gabbr1Q9WV18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Gabbr1Q9WV18 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Gabbr1Q9WV18 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gabbr1Q9WV18 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gabbr1Q9WV18 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gabbr1Q9WV18 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Gabbr1Q9WV18 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gabbr1Q9WV18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Gabbr1Q9WV18 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Gabbr1Q9WV18 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Gabbr1Q9WV18 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Gabbr1Q9WV18 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Gabbr1Q9WV18 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Gabbr1Q9WV18 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Gabbr1Q9WV18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Gabbr1Q9WV18 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gabbr1Q9WV18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Gabbr1Q9WV18 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gabbr1Q9WV18 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Gabbr1Q9WV18 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Gabbr1Q9WV18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gabbr1Q9WV18 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Gabbr1Q9WV18 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gabbr1Q9WV18 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Gabbr1Q9WV18 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gabbr1Q9WV18 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gabbr1Q9WV18 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Gabbr1Q9WV18 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Gabbr1Q9WV18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gabbr1Q9WV18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Gabbr1Q9WV18 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Gabbr1Q9WV18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Gabbr1Q9WV18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Gabbr1Q9WV18 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gabbr1Q9WV18 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gabbr1Q9WV18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gabbr1Q9WV18 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gabbr1Q9WV18 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gabbr1Q9WV18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gabbr1Q9WV18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Gabbr1Q9WV18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,7 ms