Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nrf1Q9WU00 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nrf1Q9WU00 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nrf1Q9WU00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nrf1Q9WU00 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nrf1Q9WU00 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nrf1Q9WU00 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nrf1Q9WU00 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nrf1Q9WU00 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nrf1Q9WU00 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nrf1Q9WU00 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nrf1Q9WU00 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrf1Q9WU00 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nrf1Q9WU00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrf1Q9WU00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nrf1Q9WU00 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nrf1Q9WU00 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrf1Q9WU00 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nrf1Q9WU00 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nrf1Q9WU00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nrf1Q9WU00 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nrf1Q9WU00 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nrf1Q9WU00 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrf1Q9WU00 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrf1Q9WU00 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrf1Q9WU00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrf1Q9WU00 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrf1Q9WU00 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrf1Q9WU00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nrf1Q9WU00 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrf1Q9WU00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrf1Q9WU00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nrf1Q9WU00 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nrf1Q9WU00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrf1Q9WU00 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nrf1Q9WU00 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nrf1Q9WU00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nrf1Q9WU00 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrf1Q9WU00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nrf1Q9WU00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nrf1Q9WU00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrf1Q9WU00 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrf1Q9WU00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrf1Q9WU00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrf1Q9WU00 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrf1Q9WU00 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrf1Q9WU00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrf1Q9WU00 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nrf1Q9WU00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nrf1Q9WU00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrf1Q9WU00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrf1Q9WU00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrf1Q9WU00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrf1Q9WU00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrf1Q9WU00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrf1Q9WU00 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrf1Q9WU00 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrf1Q9WU00 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrf1Q9WU00 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrf1Q9WU00 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrf1Q9WU00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrf1Q9WU00 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrf1Q9WU00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrf1Q9WU00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrf1Q9WU00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrf1Q9WU00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrf1Q9WU00 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrf1Q9WU00 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrf1Q9WU00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrf1Q9WU00 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrf1Q9WU00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrf1Q9WU00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrf1Q9WU00 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrf1Q9WU00 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrf1Q9WU00 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrf1Q9WU00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrf1Q9WU00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nrf1Q9WU00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nrf1Q9WU00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrf1Q9WU00 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrf1Q9WU00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrf1Q9WU00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrf1Q9WU00 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrf1Q9WU00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nrf1Q9WU00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms