Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,27■□□□□ 0,84
Psmb2Q9R1P3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Psmb2Q9R1P3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Psmb2Q9R1P3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Psmb2Q9R1P3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Psmb2Q9R1P3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,19■□□□□ 0,82
Psmb2Q9R1P3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Psmb2Q9R1P3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Psmb2Q9R1P3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Psmb2Q9R1P3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Psmb2Q9R1P3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Psmb2Q9R1P3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Psmb2Q9R1P3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Psmb2Q9R1P3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,11■□□□□ 0,81
Psmb2Q9R1P3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Psmb2Q9R1P3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Psmb2Q9R1P3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Psmb2Q9R1P3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Psmb2Q9R1P3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Psmb2Q9R1P3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Psmb2Q9R1P3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Psmb2Q9R1P3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Psmb2Q9R1P3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Psmb2Q9R1P3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
Psmb2Q9R1P3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Psmb2Q9R1P3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Psmb2Q9R1P3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Psmb2Q9R1P3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Psmb2Q9R1P3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Psmb2Q9R1P3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Psmb2Q9R1P3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Psmb2Q9R1P3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19,73■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Psmb2Q9R1P3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Psmb2Q9R1P3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Psmb2Q9R1P3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Psmb2Q9R1P3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Psmb2Q9R1P3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Psmb2Q9R1P3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,74
Psmb2Q9R1P3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,74
Psmb2Q9R1P3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,61■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,6■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,58■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Psmb2Q9R1P3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Psmb2Q9R1P3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Psmb2Q9R1P3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19,57■□□□□ 0,72
Psmb2Q9R1P3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19,57■□□□□ 0,72
Psmb2Q9R1P3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Psmb2Q9R1P3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Psmb2Q9R1P3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,49■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,49■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Psmb2Q9R1P3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19,45■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19,42■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19,41■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Psmb2Q9R1P3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,38■□□□□ 0,69
Psmb2Q9R1P3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Psmb2Q9R1P3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19,37■□□□□ 0,69
Psmb2Q9R1P3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Psmb2Q9R1P3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Psmb2Q9R1P3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19,36■□□□□ 0,69
Psmb2Q9R1P3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,35■□□□□ 0,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,3 ms