Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chrna6Q9R0W9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chrna6Q9R0W9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chrna6Q9R0W9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chrna6Q9R0W9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chrna6Q9R0W9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chrna6Q9R0W9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna6Q9R0W9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna6Q9R0W9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chrna6Q9R0W9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Chrna6Q9R0W9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chrna6Q9R0W9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chrna6Q9R0W9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chrna6Q9R0W9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chrna6Q9R0W9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chrna6Q9R0W9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chrna6Q9R0W9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chrna6Q9R0W9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chrna6Q9R0W9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chrna6Q9R0W9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chrna6Q9R0W9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chrna6Q9R0W9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chrna6Q9R0W9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chrna6Q9R0W9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chrna6Q9R0W9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chrna6Q9R0W9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrna6Q9R0W9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chrna6Q9R0W9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chrna6Q9R0W9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chrna6Q9R0W9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chrna6Q9R0W9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chrna6Q9R0W9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chrna6Q9R0W9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chrna6Q9R0W9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrna6Q9R0W9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Chrna6Q9R0W9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Chrna6Q9R0W9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Chrna6Q9R0W9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chrna6Q9R0W9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chrna6Q9R0W9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chrna6Q9R0W9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Chrna6Q9R0W9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chrna6Q9R0W9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna6Q9R0W9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna6Q9R0W9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chrna6Q9R0W9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna6Q9R0W9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna6Q9R0W9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna6Q9R0W9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna6Q9R0W9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Chrna6Q9R0W9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna6Q9R0W9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna6Q9R0W9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrna6Q9R0W9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chrna6Q9R0W9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chrna6Q9R0W9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna6Q9R0W9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna6Q9R0W9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna6Q9R0W9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna6Q9R0W9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrna6Q9R0W9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrna6Q9R0W9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna6Q9R0W9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna6Q9R0W9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna6Q9R0W9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna6Q9R0W9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna6Q9R0W9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna6Q9R0W9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna6Q9R0W9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna6Q9R0W9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna6Q9R0W9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna6Q9R0W9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna6Q9R0W9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna6Q9R0W9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna6Q9R0W9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna6Q9R0W9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna6Q9R0W9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrna6Q9R0W9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna6Q9R0W9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna6Q9R0W9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna6Q9R0W9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna6Q9R0W9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna6Q9R0W9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna6Q9R0W9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna6Q9R0W9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrna6Q9R0W9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrna6Q9R0W9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chrna6Q9R0W9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chrna6Q9R0W9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chrna6Q9R0W9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrna6Q9R0W9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrna6Q9R0W9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chrna6Q9R0W9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms