Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpk1Q9R0M5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpk1Q9R0M5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpk1Q9R0M5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpk1Q9R0M5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpk1Q9R0M5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tpk1Q9R0M5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tpk1Q9R0M5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpk1Q9R0M5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpk1Q9R0M5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpk1Q9R0M5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpk1Q9R0M5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpk1Q9R0M5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpk1Q9R0M5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpk1Q9R0M5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpk1Q9R0M5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpk1Q9R0M5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpk1Q9R0M5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpk1Q9R0M5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpk1Q9R0M5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpk1Q9R0M5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpk1Q9R0M5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpk1Q9R0M5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpk1Q9R0M5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpk1Q9R0M5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpk1Q9R0M5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpk1Q9R0M5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpk1Q9R0M5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpk1Q9R0M5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpk1Q9R0M5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpk1Q9R0M5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpk1Q9R0M5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpk1Q9R0M5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpk1Q9R0M5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpk1Q9R0M5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpk1Q9R0M5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpk1Q9R0M5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpk1Q9R0M5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpk1Q9R0M5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpk1Q9R0M5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpk1Q9R0M5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpk1Q9R0M5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpk1Q9R0M5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpk1Q9R0M5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpk1Q9R0M5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpk1Q9R0M5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpk1Q9R0M5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpk1Q9R0M5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpk1Q9R0M5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpk1Q9R0M5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpk1Q9R0M5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpk1Q9R0M5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpk1Q9R0M5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpk1Q9R0M5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpk1Q9R0M5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpk1Q9R0M5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpk1Q9R0M5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpk1Q9R0M5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpk1Q9R0M5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpk1Q9R0M5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpk1Q9R0M5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpk1Q9R0M5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpk1Q9R0M5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpk1Q9R0M5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpk1Q9R0M5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpk1Q9R0M5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpk1Q9R0M5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpk1Q9R0M5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpk1Q9R0M5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpk1Q9R0M5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpk1Q9R0M5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpk1Q9R0M5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpk1Q9R0M5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpk1Q9R0M5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpk1Q9R0M5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpk1Q9R0M5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpk1Q9R0M5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpk1Q9R0M5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpk1Q9R0M5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpk1Q9R0M5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpk1Q9R0M5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tpk1Q9R0M5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms