Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gpc6Q9R087 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Gpc6Q9R087 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gpc6Q9R087 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gpc6Q9R087 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gpc6Q9R087 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gpc6Q9R087 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Gpc6Q9R087 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gpc6Q9R087 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gpc6Q9R087 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Gpc6Q9R087 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Gpc6Q9R087 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Gpc6Q9R087 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Gpc6Q9R087 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gpc6Q9R087 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gpc6Q9R087 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Gpc6Q9R087 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Gpc6Q9R087 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Gpc6Q9R087 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gpc6Q9R087 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Gpc6Q9R087 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Gpc6Q9R087 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Gpc6Q9R087 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Gpc6Q9R087 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Gpc6Q9R087 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Gpc6Q9R087 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gpc6Q9R087 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gpc6Q9R087 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gpc6Q9R087 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gpc6Q9R087 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Gpc6Q9R087 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Gpc6Q9R087 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Gpc6Q9R087 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Gpc6Q9R087 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,52
Gpc6Q9R087 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Gpc6Q9R087 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Gpc6Q9R087 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Gpc6Q9R087 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Gpc6Q9R087 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Gpc6Q9R087 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Gpc6Q9R087 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Gpc6Q9R087 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Gpc6Q9R087 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Gpc6Q9R087 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Gpc6Q9R087 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gpc6Q9R087 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Gpc6Q9R087 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Gpc6Q9R087 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Gpc6Q9R087 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Gpc6Q9R087 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Gpc6Q9R087 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gpc6Q9R087 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gpc6Q9R087 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Gpc6Q9R087 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Gpc6Q9R087 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Gpc6Q9R087 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Gpc6Q9R087 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Gpc6Q9R087 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Gpc6Q9R087 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gpc6Q9R087 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Gpc6Q9R087 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gpc6Q9R087 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
Gpc6Q9R087 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Gpc6Q9R087 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Gpc6Q9R087 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gpc6Q9R087 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gpc6Q9R087 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Gpc6Q9R087 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Gpc6Q9R087 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Gpc6Q9R087 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gpc6Q9R087 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Gpc6Q9R087 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gpc6Q9R087 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Gpc6Q9R087 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gpc6Q9R087 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gpc6Q9R087 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Gpc6Q9R087 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gpc6Q9R087 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Gpc6Q9R087 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Gpc6Q9R087 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Gpc6Q9R087 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
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