Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Itgb1bp2Q9R000 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Itgb1bp2Q9R000 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Itgb1bp2Q9R000 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Itgb1bp2Q9R000 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Itgb1bp2Q9R000 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Itgb1bp2Q9R000 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Itgb1bp2Q9R000 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Itgb1bp2Q9R000 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Itgb1bp2Q9R000 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Itgb1bp2Q9R000 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Itgb1bp2Q9R000 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Itgb1bp2Q9R000 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Itgb1bp2Q9R000 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Itgb1bp2Q9R000 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Itgb1bp2Q9R000 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Itgb1bp2Q9R000 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Itgb1bp2Q9R000 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,64■■□□□ 1,85
Itgb1bp2Q9R000 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Itgb1bp2Q9R000 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Itgb1bp2Q9R000 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Itgb1bp2Q9R000 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Itgb1bp2Q9R000 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Itgb1bp2Q9R000 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Itgb1bp2Q9R000 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Itgb1bp2Q9R000 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Itgb1bp2Q9R000 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Itgb1bp2Q9R000 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Itgb1bp2Q9R000 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Itgb1bp2Q9R000 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Itgb1bp2Q9R000 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Itgb1bp2Q9R000 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Itgb1bp2Q9R000 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Itgb1bp2Q9R000 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Itgb1bp2Q9R000 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Itgb1bp2Q9R000 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Itgb1bp2Q9R000 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Itgb1bp2Q9R000 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Itgb1bp2Q9R000 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Itgb1bp2Q9R000 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Itgb1bp2Q9R000 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Itgb1bp2Q9R000 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Itgb1bp2Q9R000 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Itgb1bp2Q9R000 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Itgb1bp2Q9R000 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Itgb1bp2Q9R000 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Itgb1bp2Q9R000 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Itgb1bp2Q9R000 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Itgb1bp2Q9R000 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Itgb1bp2Q9R000 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Itgb1bp2Q9R000 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Itgb1bp2Q9R000 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Itgb1bp2Q9R000 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Itgb1bp2Q9R000 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Itgb1bp2Q9R000 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Itgb1bp2Q9R000 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Itgb1bp2Q9R000 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Itgb1bp2Q9R000 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Itgb1bp2Q9R000 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Itgb1bp2Q9R000 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Itgb1bp2Q9R000 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Itgb1bp2Q9R000 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Itgb1bp2Q9R000 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Itgb1bp2Q9R000 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Itgb1bp2Q9R000 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Itgb1bp2Q9R000 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Itgb1bp2Q9R000 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Itgb1bp2Q9R000 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,8 ms