Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp11cQ9QZW0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp11cQ9QZW0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp11cQ9QZW0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp11cQ9QZW0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp11cQ9QZW0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp11cQ9QZW0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp11cQ9QZW0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp11cQ9QZW0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp11cQ9QZW0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp11cQ9QZW0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp11cQ9QZW0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp11cQ9QZW0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp11cQ9QZW0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp11cQ9QZW0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp11cQ9QZW0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp11cQ9QZW0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp11cQ9QZW0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp11cQ9QZW0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp11cQ9QZW0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp11cQ9QZW0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp11cQ9QZW0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp11cQ9QZW0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp11cQ9QZW0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp11cQ9QZW0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp11cQ9QZW0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp11cQ9QZW0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp11cQ9QZW0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp11cQ9QZW0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp11cQ9QZW0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp11cQ9QZW0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp11cQ9QZW0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp11cQ9QZW0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp11cQ9QZW0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp11cQ9QZW0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp11cQ9QZW0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp11cQ9QZW0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp11cQ9QZW0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp11cQ9QZW0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp11cQ9QZW0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp11cQ9QZW0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp11cQ9QZW0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp11cQ9QZW0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp11cQ9QZW0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp11cQ9QZW0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp11cQ9QZW0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp11cQ9QZW0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp11cQ9QZW0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp11cQ9QZW0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp11cQ9QZW0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp11cQ9QZW0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp11cQ9QZW0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp11cQ9QZW0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp11cQ9QZW0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp11cQ9QZW0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp11cQ9QZW0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp11cQ9QZW0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp11cQ9QZW0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp11cQ9QZW0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp11cQ9QZW0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp11cQ9QZW0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp11cQ9QZW0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atp11cQ9QZW0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp11cQ9QZW0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp11cQ9QZW0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp11cQ9QZW0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp11cQ9QZW0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp11cQ9QZW0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp11cQ9QZW0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp11cQ9QZW0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp11cQ9QZW0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp11cQ9QZW0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp11cQ9QZW0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp11cQ9QZW0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp11cQ9QZW0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp11cQ9QZW0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp11cQ9QZW0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp11cQ9QZW0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp11cQ9QZW0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp11cQ9QZW0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp11cQ9QZW0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp11cQ9QZW0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp11cQ9QZW0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp11cQ9QZW0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp11cQ9QZW0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp11cQ9QZW0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp11cQ9QZW0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp11cQ9QZW0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp11cQ9QZW0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp11cQ9QZW0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp11cQ9QZW0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp11cQ9QZW0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp11cQ9QZW0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp11cQ9QZW0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp11cQ9QZW0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp11cQ9QZW0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp11cQ9QZW0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp11cQ9QZW0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms