Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nphs1Q9QZS7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nphs1Q9QZS7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nphs1Q9QZS7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nphs1Q9QZS7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nphs1Q9QZS7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nphs1Q9QZS7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nphs1Q9QZS7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nphs1Q9QZS7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphs1Q9QZS7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphs1Q9QZS7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphs1Q9QZS7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphs1Q9QZS7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphs1Q9QZS7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nphs1Q9QZS7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nphs1Q9QZS7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphs1Q9QZS7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nphs1Q9QZS7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphs1Q9QZS7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphs1Q9QZS7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphs1Q9QZS7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphs1Q9QZS7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nphs1Q9QZS7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nphs1Q9QZS7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nphs1Q9QZS7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphs1Q9QZS7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nphs1Q9QZS7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nphs1Q9QZS7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nphs1Q9QZS7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nphs1Q9QZS7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nphs1Q9QZS7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nphs1Q9QZS7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nphs1Q9QZS7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nphs1Q9QZS7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphs1Q9QZS7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphs1Q9QZS7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphs1Q9QZS7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphs1Q9QZS7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphs1Q9QZS7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nphs1Q9QZS7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nphs1Q9QZS7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nphs1Q9QZS7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nphs1Q9QZS7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms