Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndrg3Q9QYF9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndrg3Q9QYF9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndrg3Q9QYF9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndrg3Q9QYF9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndrg3Q9QYF9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndrg3Q9QYF9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndrg3Q9QYF9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndrg3Q9QYF9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndrg3Q9QYF9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ndrg3Q9QYF9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndrg3Q9QYF9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndrg3Q9QYF9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndrg3Q9QYF9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndrg3Q9QYF9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndrg3Q9QYF9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndrg3Q9QYF9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndrg3Q9QYF9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndrg3Q9QYF9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndrg3Q9QYF9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndrg3Q9QYF9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndrg3Q9QYF9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg3Q9QYF9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndrg3Q9QYF9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndrg3Q9QYF9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndrg3Q9QYF9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndrg3Q9QYF9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ndrg3Q9QYF9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndrg3Q9QYF9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndrg3Q9QYF9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndrg3Q9QYF9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ndrg3Q9QYF9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg3Q9QYF9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndrg3Q9QYF9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndrg3Q9QYF9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndrg3Q9QYF9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndrg3Q9QYF9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndrg3Q9QYF9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndrg3Q9QYF9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndrg3Q9QYF9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndrg3Q9QYF9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndrg3Q9QYF9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndrg3Q9QYF9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndrg3Q9QYF9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg3Q9QYF9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndrg3Q9QYF9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndrg3Q9QYF9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg3Q9QYF9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndrg3Q9QYF9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndrg3Q9QYF9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndrg3Q9QYF9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndrg3Q9QYF9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndrg3Q9QYF9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndrg3Q9QYF9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg3Q9QYF9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg3Q9QYF9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg3Q9QYF9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg3Q9QYF9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndrg3Q9QYF9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndrg3Q9QYF9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndrg3Q9QYF9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndrg3Q9QYF9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndrg3Q9QYF9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndrg3Q9QYF9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndrg3Q9QYF9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndrg3Q9QYF9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg3Q9QYF9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg3Q9QYF9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndrg3Q9QYF9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg3Q9QYF9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms