Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Nphp1Q9QY53 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,44■■■■□ 3,1
Nphp1Q9QY53 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Nphp1Q9QY53 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Nphp1Q9QY53 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Nphp1Q9QY53 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Nphp1Q9QY53 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Nphp1Q9QY53 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Nphp1Q9QY53 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Nphp1Q9QY53 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Nphp1Q9QY53 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Nphp1Q9QY53 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Nphp1Q9QY53 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nphp1Q9QY53 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Nphp1Q9QY53 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Nphp1Q9QY53 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Nphp1Q9QY53 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Nphp1Q9QY53 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Nphp1Q9QY53 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Nphp1Q9QY53 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Nphp1Q9QY53 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Nphp1Q9QY53 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Nphp1Q9QY53 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Nphp1Q9QY53 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nphp1Q9QY53 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Nphp1Q9QY53 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Nphp1Q9QY53 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Nphp1Q9QY53 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Nphp1Q9QY53 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Nphp1Q9QY53 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Nphp1Q9QY53 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Nphp1Q9QY53 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,76■■■□□ 2,99
Nphp1Q9QY53 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Nphp1Q9QY53 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
Nphp1Q9QY53 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Nphp1Q9QY53 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,66■■■□□ 2,98
Nphp1Q9QY53 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Nphp1Q9QY53 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Nphp1Q9QY53 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Nphp1Q9QY53 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Nphp1Q9QY53 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Nphp1Q9QY53 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Nphp1Q9QY53 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Nphp1Q9QY53 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Nphp1Q9QY53 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Nphp1Q9QY53 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Nphp1Q9QY53 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Nphp1Q9QY53 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Nphp1Q9QY53 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Nphp1Q9QY53 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Nphp1Q9QY53 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Nphp1Q9QY53 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Nphp1Q9QY53 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Nphp1Q9QY53 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Nphp1Q9QY53 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Nphp1Q9QY53 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,28■■■□□ 2,92
Nphp1Q9QY53 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Nphp1Q9QY53 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Nphp1Q9QY53 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Nphp1Q9QY53 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Nphp1Q9QY53 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Nphp1Q9QY53 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Nphp1Q9QY53 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Nphp1Q9QY53 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Nphp1Q9QY53 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Nphp1Q9QY53 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Nphp1Q9QY53 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Nphp1Q9QY53 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Nphp1Q9QY53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Nphp1Q9QY53 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Nphp1Q9QY53 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Nphp1Q9QY53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Nphp1Q9QY53 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,88■■■□□ 2,85
Nphp1Q9QY53 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Nphp1Q9QY53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Nphp1Q9QY53 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,84■■■□□ 2,85
Nphp1Q9QY53 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Nphp1Q9QY53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Nphp1Q9QY53 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Nphp1Q9QY53 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Nphp1Q9QY53 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Nphp1Q9QY53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Nphp1Q9QY53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Nphp1Q9QY53 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Nphp1Q9QY53 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,66■■■□□ 2,82
Nphp1Q9QY53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Nphp1Q9QY53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Nphp1Q9QY53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Nphp1Q9QY53 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Nphp1Q9QY53 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Nphp1Q9QY53 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Nphp1Q9QY53 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,3 ms