Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fscn3Q9QXW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fscn3Q9QXW4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fscn3Q9QXW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fscn3Q9QXW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fscn3Q9QXW4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fscn3Q9QXW4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fscn3Q9QXW4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fscn3Q9QXW4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fscn3Q9QXW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fscn3Q9QXW4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fscn3Q9QXW4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fscn3Q9QXW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fscn3Q9QXW4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fscn3Q9QXW4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fscn3Q9QXW4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn3Q9QXW4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn3Q9QXW4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fscn3Q9QXW4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn3Q9QXW4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn3Q9QXW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn3Q9QXW4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fscn3Q9QXW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fscn3Q9QXW4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fscn3Q9QXW4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn3Q9QXW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn3Q9QXW4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn3Q9QXW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn3Q9QXW4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fscn3Q9QXW4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fscn3Q9QXW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn3Q9QXW4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn3Q9QXW4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn3Q9QXW4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fscn3Q9QXW4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fscn3Q9QXW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fscn3Q9QXW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fscn3Q9QXW4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fscn3Q9QXW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fscn3Q9QXW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fscn3Q9QXW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fscn3Q9QXW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fscn3Q9QXW4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fscn3Q9QXW4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fscn3Q9QXW4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fscn3Q9QXW4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fscn3Q9QXW4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fscn3Q9QXW4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fscn3Q9QXW4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fscn3Q9QXW4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fscn3Q9QXW4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn3Q9QXW4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fscn3Q9QXW4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fscn3Q9QXW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fscn3Q9QXW4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fscn3Q9QXW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fscn3Q9QXW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn3Q9QXW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fscn3Q9QXW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fscn3Q9QXW4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fscn3Q9QXW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fscn3Q9QXW4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fscn3Q9QXW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fscn3Q9QXW4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fscn3Q9QXW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fscn3Q9QXW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fscn3Q9QXW4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fscn3Q9QXW4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fscn3Q9QXW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fscn3Q9QXW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fscn3Q9QXW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fscn3Q9QXW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fscn3Q9QXW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fscn3Q9QXW4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fscn3Q9QXW4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fscn3Q9QXW4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fscn3Q9QXW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fscn3Q9QXW4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fscn3Q9QXW4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn3Q9QXW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fscn3Q9QXW4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn3Q9QXW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fscn3Q9QXW4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn3Q9QXW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn3Q9QXW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn3Q9QXW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fscn3Q9QXW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fscn3Q9QXW4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn3Q9QXW4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn3Q9QXW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn3Q9QXW4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fscn3Q9QXW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms