Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dkk3Q9QUN9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dkk3Q9QUN9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dkk3Q9QUN9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dkk3Q9QUN9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dkk3Q9QUN9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dkk3Q9QUN9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Dkk3Q9QUN9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dkk3Q9QUN9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dkk3Q9QUN9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dkk3Q9QUN9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dkk3Q9QUN9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dkk3Q9QUN9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dkk3Q9QUN9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dkk3Q9QUN9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Dkk3Q9QUN9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dkk3Q9QUN9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dkk3Q9QUN9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dkk3Q9QUN9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dkk3Q9QUN9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dkk3Q9QUN9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dkk3Q9QUN9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dkk3Q9QUN9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dkk3Q9QUN9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dkk3Q9QUN9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dkk3Q9QUN9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dkk3Q9QUN9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dkk3Q9QUN9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dkk3Q9QUN9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dkk3Q9QUN9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dkk3Q9QUN9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dkk3Q9QUN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dkk3Q9QUN9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dkk3Q9QUN9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dkk3Q9QUN9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dkk3Q9QUN9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dkk3Q9QUN9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dkk3Q9QUN9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dkk3Q9QUN9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dkk3Q9QUN9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dkk3Q9QUN9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dkk3Q9QUN9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dkk3Q9QUN9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dkk3Q9QUN9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Dkk3Q9QUN9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dkk3Q9QUN9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dkk3Q9QUN9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dkk3Q9QUN9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dkk3Q9QUN9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Dkk3Q9QUN9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dkk3Q9QUN9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Dkk3Q9QUN9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dkk3Q9QUN9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dkk3Q9QUN9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dkk3Q9QUN9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dkk3Q9QUN9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dkk3Q9QUN9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Dkk3Q9QUN9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dkk3Q9QUN9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dkk3Q9QUN9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dkk3Q9QUN9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dkk3Q9QUN9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dkk3Q9QUN9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dkk3Q9QUN9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dkk3Q9QUN9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dkk3Q9QUN9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dkk3Q9QUN9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dkk3Q9QUN9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dkk3Q9QUN9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dkk3Q9QUN9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dkk3Q9QUN9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dkk3Q9QUN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Dkk3Q9QUN9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dkk3Q9QUN9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dkk3Q9QUN9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dkk3Q9QUN9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dkk3Q9QUN9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dkk3Q9QUN9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dkk3Q9QUN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dkk3Q9QUN9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dkk3Q9QUN9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dkk3Q9QUN9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dkk3Q9QUN9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dkk3Q9QUN9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dkk3Q9QUN9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dkk3Q9QUN9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dkk3Q9QUN9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dkk3Q9QUN9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dkk3Q9QUN9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms