Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.176e-15■■■■■ 64
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-16■■■■■ 63.6
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-16■■■■■ 63.6
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-16■■■■■ 63.6
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.414e-16■■■■■ 63.6
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.414e-16■■■■■ 63.6
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-203ENST00000468658 1826 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.464e-16■■■■■ 63.6
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-207ENST00000477024 1972 ntTSL 25.5□□□□□ -1.534e-16■■■■■ 63.6
EXOSC5Q9NQT4 CACNA2D3-204ENST00000471363 3477 ntTSL 1 (best)5.47□□□□□ -1.534e-16■■■■■ 63.6
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EXOSC5Q9NQT4 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.234e-9■■■■■ 61.9
EXOSC5Q9NQT4 SIN3B-205ENST00000595049 904 ntTSL 217.26■□□□□ 0.351e-10■■■■■ 61.6
EXOSC5Q9NQT4 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 61.6
EXOSC5Q9NQT4 USP36-204ENST00000586066 960 ntTSL 55.79□□□□□ -1.485e-9■■■■■ 61.6
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EXOSC5Q9NQT4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.386e-10■■■■■ 60.8
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EXOSC5Q9NQT4 HSD17B4-203ENST00000442060 2686 ntTSL 511.77□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 60.8
EXOSC5Q9NQT4 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.546e-10■■■■■ 60.8
EXOSC5Q9NQT4 HSD17B4-219ENST00000512841 584 ntTSL 29.95□□□□□ -0.826e-10■■■■■ 60.8
EXOSC5Q9NQT4 HSD17B4-221ENST00000515235 5540 ntTSL 28.48□□□□□ -1.056e-10■■■■■ 60.8
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EXOSC5Q9NQT4 HSD17B4-204ENST00000503168 589 ntTSL 25.53□□□□□ -1.526e-10■■■■■ 60.8
EXOSC5Q9NQT4 HSD17B4-209ENST00000507695 324 ntTSL 54.22□□□□□ -1.736e-10■■■■■ 60.8
EXOSC5Q9NQT4 FOXJ3-207ENST00000445886 1326 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 60.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 60.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 60.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 60.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 60.4
EXOSC5Q9NQT4 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 60.4
EXOSC5Q9NQT4 BX322639.1-204ENST00000609502 556 ntTSL 411.58□□□□□ -0.563e-15■■■■■ 59.7
EXOSC5Q9NQT4 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.523e-15■■■■■ 59.7
EXOSC5Q9NQT4 BX322639.1-203ENST00000609034 576 ntTSL 35.26□□□□□ -1.573e-15■■■■■ 59.7
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-210ENST00000446903 2464 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.494e-13■■■■■ 59.6
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 511.72□□□□□ -0.534e-13■■■■■ 59.6
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-206ENST00000423413 548 ntTSL 38.79□□□□□ -14e-13■■■■■ 59.6
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-203ENST00000413280 667 ntTSL 47.56□□□□□ -1.24e-13■■■■■ 59.6
EXOSC5Q9NQT4 TNS1-211ENST00000449814 582 ntTSL 35.29□□□□□ -1.564e-13■■■■■ 59.6
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EXOSC5Q9NQT4 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.374e-15■■■■■ 59.1
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EXOSC5Q9NQT4 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.584e-19■■■■■ 58.8
EXOSC5Q9NQT4 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 411.32□□□□□ -0.64e-19■■■■■ 58.8
EXOSC5Q9NQT4 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.634e-19■■■■■ 58.8
EXOSC5Q9NQT4 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.374e-19■■■■■ 58.8
EXOSC5Q9NQT4 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 25.47□□□□□ -1.534e-19■■■■■ 58.8
EXOSC5Q9NQT4 ERBIN-206ENST00000503913 544 ntTSL 35.32□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 58.7
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EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 58.5
EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 37.6□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 58.5
EXOSC5Q9NQT4 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 57.34□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 58.5
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EXOSC5Q9NQT4 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 58.01□□□□□ -1.138e-10■■■■■ 58.5
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EXOSC5Q9NQT4 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.278e-10■■■■■ 58.5
EXOSC5Q9NQT4 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.388e-10■■■■■ 58.5
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EXOSC5Q9NQT4 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 57.7
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EXOSC5Q9NQT4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 57.7
EXOSC5Q9NQT4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 57.7
EXOSC5Q9NQT4 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 511.87□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 57.7
EXOSC5Q9NQT4 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 321.03■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 57.4
EXOSC5Q9NQT4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 57.4
EXOSC5Q9NQT4 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 214.32□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 57.4
EXOSC5Q9NQT4 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 57.4
EXOSC5Q9NQT4 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC3.9□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 57.2
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-204ENST00000440042 552 ntTSL 314.86□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-211ENST00000490200 563 ntTSL 414.82□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-206ENST00000461711 528 ntTSL 413.66□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-205ENST00000457954 647 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-212ENST00000495601 611 ntTSL 28.33□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 ORC4-203ENST00000416719 571 ntTSL 32.98□□□□□ -1.932e-7■■■■■ 57.1
EXOSC5Q9NQT4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 56.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 56.8
EXOSC5Q9NQT4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 56.8
EXOSC5Q9NQT4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 56.8
EXOSC5Q9NQT4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 56.8
EXOSC5Q9NQT4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 56.8
EXOSC5Q9NQT4 AC013394.1-202ENST00000630790 4499 ntTSL 26.88□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 56.8
EXOSC5Q9NQT4 ALDH1L1-AS1-201ENST00000512384 437 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.211e-14■■■■■ 56.6
EXOSC5Q9NQT4 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 56.6
EXOSC5Q9NQT4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 56.3
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-211ENST00000598603 784 ntTSL 215.06■□□□□ 03e-7■■■■■ 56.3
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.076e-8■■■■■ 55.7
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 55.7
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