Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cul3Q9JLV5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul3Q9JLV5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cul3Q9JLV5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cul3Q9JLV5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cul3Q9JLV5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cul3Q9JLV5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cul3Q9JLV5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cul3Q9JLV5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cul3Q9JLV5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cul3Q9JLV5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cul3Q9JLV5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul3Q9JLV5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cul3Q9JLV5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cul3Q9JLV5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cul3Q9JLV5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul3Q9JLV5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cul3Q9JLV5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cul3Q9JLV5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul3Q9JLV5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cul3Q9JLV5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul3Q9JLV5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul3Q9JLV5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cul3Q9JLV5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul3Q9JLV5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul3Q9JLV5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul3Q9JLV5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul3Q9JLV5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul3Q9JLV5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul3Q9JLV5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul3Q9JLV5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul3Q9JLV5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul3Q9JLV5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul3Q9JLV5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul3Q9JLV5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul3Q9JLV5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul3Q9JLV5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul3Q9JLV5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul3Q9JLV5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul3Q9JLV5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul3Q9JLV5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul3Q9JLV5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cul3Q9JLV5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cul3Q9JLV5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cul3Q9JLV5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul3Q9JLV5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cul3Q9JLV5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cul3Q9JLV5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul3Q9JLV5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul3Q9JLV5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cul3Q9JLV5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cul3Q9JLV5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cul3Q9JLV5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cul3Q9JLV5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cul3Q9JLV5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cul3Q9JLV5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cul3Q9JLV5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cul3Q9JLV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cul3Q9JLV5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cul3Q9JLV5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cul3Q9JLV5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cul3Q9JLV5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul3Q9JLV5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cul3Q9JLV5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cul3Q9JLV5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cul3Q9JLV5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul3Q9JLV5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul3Q9JLV5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cul3Q9JLV5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cul3Q9JLV5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cul3Q9JLV5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul3Q9JLV5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cul3Q9JLV5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cul3Q9JLV5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul3Q9JLV5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cul3Q9JLV5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul3Q9JLV5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cul3Q9JLV5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cul3Q9JLV5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul3Q9JLV5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cul3Q9JLV5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul3Q9JLV5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul3Q9JLV5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul3Q9JLV5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul3Q9JLV5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms