Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cabp2Q9JLK4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cabp2Q9JLK4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Cabp2Q9JLK4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cabp2Q9JLK4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cabp2Q9JLK4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cabp2Q9JLK4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cabp2Q9JLK4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cabp2Q9JLK4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cabp2Q9JLK4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cabp2Q9JLK4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cabp2Q9JLK4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cabp2Q9JLK4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cabp2Q9JLK4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cabp2Q9JLK4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cabp2Q9JLK4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cabp2Q9JLK4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Cabp2Q9JLK4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cabp2Q9JLK4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cabp2Q9JLK4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cabp2Q9JLK4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cabp2Q9JLK4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Cabp2Q9JLK4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cabp2Q9JLK4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cabp2Q9JLK4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cabp2Q9JLK4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cabp2Q9JLK4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cabp2Q9JLK4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cabp2Q9JLK4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Cabp2Q9JLK4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Cabp2Q9JLK4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cabp2Q9JLK4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cabp2Q9JLK4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cabp2Q9JLK4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cabp2Q9JLK4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cabp2Q9JLK4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cabp2Q9JLK4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cabp2Q9JLK4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cabp2Q9JLK4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cabp2Q9JLK4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cabp2Q9JLK4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cabp2Q9JLK4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cabp2Q9JLK4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cabp2Q9JLK4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Cabp2Q9JLK4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Cabp2Q9JLK4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cabp2Q9JLK4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cabp2Q9JLK4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cabp2Q9JLK4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cabp2Q9JLK4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cabp2Q9JLK4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cabp2Q9JLK4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cabp2Q9JLK4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cabp2Q9JLK4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cabp2Q9JLK4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cabp2Q9JLK4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cabp2Q9JLK4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cabp2Q9JLK4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cabp2Q9JLK4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cabp2Q9JLK4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Cabp2Q9JLK4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp2Q9JLK4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp2Q9JLK4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cabp2Q9JLK4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cabp2Q9JLK4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cabp2Q9JLK4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cabp2Q9JLK4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cabp2Q9JLK4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cabp2Q9JLK4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cabp2Q9JLK4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cabp2Q9JLK4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cabp2Q9JLK4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cabp2Q9JLK4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cabp2Q9JLK4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cabp2Q9JLK4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cabp2Q9JLK4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cabp2Q9JLK4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cabp2Q9JLK4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cabp2Q9JLK4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cabp2Q9JLK4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cabp2Q9JLK4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cabp2Q9JLK4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cabp2Q9JLK4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cabp2Q9JLK4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cabp2Q9JLK4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cabp2Q9JLK4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms