Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nectin3Q9JLB9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nectin3Q9JLB9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nectin3Q9JLB9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nectin3Q9JLB9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nectin3Q9JLB9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nectin3Q9JLB9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nectin3Q9JLB9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nectin3Q9JLB9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nectin3Q9JLB9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nectin3Q9JLB9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nectin3Q9JLB9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nectin3Q9JLB9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nectin3Q9JLB9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nectin3Q9JLB9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nectin3Q9JLB9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nectin3Q9JLB9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nectin3Q9JLB9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nectin3Q9JLB9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nectin3Q9JLB9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nectin3Q9JLB9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nectin3Q9JLB9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nectin3Q9JLB9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nectin3Q9JLB9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nectin3Q9JLB9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nectin3Q9JLB9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nectin3Q9JLB9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nectin3Q9JLB9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nectin3Q9JLB9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nectin3Q9JLB9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nectin3Q9JLB9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nectin3Q9JLB9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nectin3Q9JLB9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nectin3Q9JLB9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nectin3Q9JLB9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nectin3Q9JLB9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nectin3Q9JLB9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nectin3Q9JLB9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nectin3Q9JLB9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nectin3Q9JLB9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nectin3Q9JLB9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nectin3Q9JLB9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nectin3Q9JLB9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nectin3Q9JLB9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nectin3Q9JLB9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nectin3Q9JLB9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nectin3Q9JLB9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nectin3Q9JLB9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nectin3Q9JLB9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nectin3Q9JLB9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nectin3Q9JLB9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nectin3Q9JLB9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nectin3Q9JLB9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nectin3Q9JLB9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nectin3Q9JLB9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nectin3Q9JLB9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nectin3Q9JLB9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nectin3Q9JLB9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nectin3Q9JLB9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nectin3Q9JLB9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nectin3Q9JLB9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nectin3Q9JLB9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nectin3Q9JLB9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nectin3Q9JLB9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nectin3Q9JLB9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nectin3Q9JLB9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nectin3Q9JLB9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nectin3Q9JLB9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nectin3Q9JLB9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nectin3Q9JLB9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nectin3Q9JLB9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nectin3Q9JLB9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nectin3Q9JLB9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nectin3Q9JLB9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nectin3Q9JLB9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nectin3Q9JLB9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nectin3Q9JLB9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nectin3Q9JLB9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nectin3Q9JLB9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nectin3Q9JLB9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nectin3Q9JLB9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms