Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl39Q9JKF7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl39Q9JKF7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrpl39Q9JKF7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl39Q9JKF7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl39Q9JKF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl39Q9JKF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl39Q9JKF7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl39Q9JKF7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl39Q9JKF7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl39Q9JKF7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl39Q9JKF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl39Q9JKF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl39Q9JKF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl39Q9JKF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl39Q9JKF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl39Q9JKF7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl39Q9JKF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl39Q9JKF7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl39Q9JKF7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl39Q9JKF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl39Q9JKF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl39Q9JKF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl39Q9JKF7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl39Q9JKF7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl39Q9JKF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl39Q9JKF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl39Q9JKF7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl39Q9JKF7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl39Q9JKF7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl39Q9JKF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl39Q9JKF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl39Q9JKF7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl39Q9JKF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl39Q9JKF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl39Q9JKF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl39Q9JKF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl39Q9JKF7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl39Q9JKF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl39Q9JKF7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl39Q9JKF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl39Q9JKF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl39Q9JKF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl39Q9JKF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl39Q9JKF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl39Q9JKF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl39Q9JKF7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl39Q9JKF7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl39Q9JKF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl39Q9JKF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl39Q9JKF7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl39Q9JKF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl39Q9JKF7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl39Q9JKF7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mrpl39Q9JKF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl39Q9JKF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl39Q9JKF7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mrpl39Q9JKF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mrpl39Q9JKF7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mrpl39Q9JKF7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms