Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Akip1Q9JJR5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Akip1Q9JJR5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Akip1Q9JJR5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Akip1Q9JJR5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Akip1Q9JJR5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Akip1Q9JJR5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Akip1Q9JJR5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Akip1Q9JJR5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Akip1Q9JJR5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Akip1Q9JJR5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Akip1Q9JJR5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Akip1Q9JJR5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Akip1Q9JJR5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Akip1Q9JJR5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Akip1Q9JJR5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Akip1Q9JJR5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Akip1Q9JJR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Akip1Q9JJR5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Akip1Q9JJR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Akip1Q9JJR5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Akip1Q9JJR5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Akip1Q9JJR5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Akip1Q9JJR5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Akip1Q9JJR5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Akip1Q9JJR5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Akip1Q9JJR5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Akip1Q9JJR5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Akip1Q9JJR5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Akip1Q9JJR5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Akip1Q9JJR5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Akip1Q9JJR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Akip1Q9JJR5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Akip1Q9JJR5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Akip1Q9JJR5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Akip1Q9JJR5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Akip1Q9JJR5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Akip1Q9JJR5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Akip1Q9JJR5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Akip1Q9JJR5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Akip1Q9JJR5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Akip1Q9JJR5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Akip1Q9JJR5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Akip1Q9JJR5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Akip1Q9JJR5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Akip1Q9JJR5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Akip1Q9JJR5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Akip1Q9JJR5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Akip1Q9JJR5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Akip1Q9JJR5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Akip1Q9JJR5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Akip1Q9JJR5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Akip1Q9JJR5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Akip1Q9JJR5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Akip1Q9JJR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Akip1Q9JJR5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Akip1Q9JJR5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Akip1Q9JJR5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Akip1Q9JJR5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Akip1Q9JJR5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Akip1Q9JJR5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Akip1Q9JJR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Akip1Q9JJR5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Akip1Q9JJR5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Akip1Q9JJR5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Akip1Q9JJR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Akip1Q9JJR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Akip1Q9JJR5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Akip1Q9JJR5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Akip1Q9JJR5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Akip1Q9JJR5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Akip1Q9JJR5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Akip1Q9JJR5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Akip1Q9JJR5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Akip1Q9JJR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Akip1Q9JJR5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Akip1Q9JJR5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Akip1Q9JJR5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akip1Q9JJR5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Akip1Q9JJR5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Akip1Q9JJR5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Akip1Q9JJR5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Akip1Q9JJR5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms