Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herpud1Q9JJK5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herpud1Q9JJK5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herpud1Q9JJK5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herpud1Q9JJK5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Herpud1Q9JJK5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Herpud1Q9JJK5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Herpud1Q9JJK5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Herpud1Q9JJK5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Herpud1Q9JJK5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Herpud1Q9JJK5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herpud1Q9JJK5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Herpud1Q9JJK5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Herpud1Q9JJK5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Herpud1Q9JJK5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herpud1Q9JJK5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Herpud1Q9JJK5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Herpud1Q9JJK5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Herpud1Q9JJK5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Herpud1Q9JJK5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Herpud1Q9JJK5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herpud1Q9JJK5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Herpud1Q9JJK5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Herpud1Q9JJK5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Herpud1Q9JJK5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Herpud1Q9JJK5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Herpud1Q9JJK5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Herpud1Q9JJK5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herpud1Q9JJK5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Herpud1Q9JJK5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Herpud1Q9JJK5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Herpud1Q9JJK5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herpud1Q9JJK5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Herpud1Q9JJK5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herpud1Q9JJK5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Herpud1Q9JJK5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Herpud1Q9JJK5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Herpud1Q9JJK5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Herpud1Q9JJK5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herpud1Q9JJK5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herpud1Q9JJK5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herpud1Q9JJK5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herpud1Q9JJK5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herpud1Q9JJK5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herpud1Q9JJK5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herpud1Q9JJK5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herpud1Q9JJK5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herpud1Q9JJK5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Herpud1Q9JJK5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herpud1Q9JJK5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herpud1Q9JJK5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herpud1Q9JJK5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herpud1Q9JJK5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herpud1Q9JJK5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herpud1Q9JJK5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Herpud1Q9JJK5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herpud1Q9JJK5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herpud1Q9JJK5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Herpud1Q9JJK5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Herpud1Q9JJK5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Herpud1Q9JJK5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Herpud1Q9JJK5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Herpud1Q9JJK5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Herpud1Q9JJK5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Herpud1Q9JJK5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herpud1Q9JJK5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Herpud1Q9JJK5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herpud1Q9JJK5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herpud1Q9JJK5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud1Q9JJK5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud1Q9JJK5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms