Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClpxQ9JHS4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ClpxQ9JHS4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ClpxQ9JHS4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ClpxQ9JHS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ClpxQ9JHS4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ClpxQ9JHS4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClpxQ9JHS4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClpxQ9JHS4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClpxQ9JHS4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ClpxQ9JHS4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClpxQ9JHS4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClpxQ9JHS4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClpxQ9JHS4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClpxQ9JHS4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClpxQ9JHS4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClpxQ9JHS4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ClpxQ9JHS4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClpxQ9JHS4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClpxQ9JHS4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClpxQ9JHS4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClpxQ9JHS4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClpxQ9JHS4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClpxQ9JHS4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClpxQ9JHS4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClpxQ9JHS4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ClpxQ9JHS4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClpxQ9JHS4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClpxQ9JHS4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClpxQ9JHS4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClpxQ9JHS4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClpxQ9JHS4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClpxQ9JHS4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClpxQ9JHS4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ClpxQ9JHS4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClpxQ9JHS4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClpxQ9JHS4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ClpxQ9JHS4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClpxQ9JHS4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClpxQ9JHS4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ClpxQ9JHS4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClpxQ9JHS4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ClpxQ9JHS4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClpxQ9JHS4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClpxQ9JHS4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClpxQ9JHS4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ClpxQ9JHS4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ClpxQ9JHS4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ClpxQ9JHS4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ClpxQ9JHS4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ClpxQ9JHS4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ClpxQ9JHS4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClpxQ9JHS4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ClpxQ9JHS4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClpxQ9JHS4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClpxQ9JHS4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ClpxQ9JHS4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ClpxQ9JHS4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ClpxQ9JHS4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ClpxQ9JHS4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ClpxQ9JHS4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ClpxQ9JHS4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClpxQ9JHS4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClpxQ9JHS4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClpxQ9JHS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClpxQ9JHS4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClpxQ9JHS4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClpxQ9JHS4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ClpxQ9JHS4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClpxQ9JHS4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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