Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copz2Q9JHH9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copz2Q9JHH9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Copz2Q9JHH9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copz2Q9JHH9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copz2Q9JHH9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copz2Q9JHH9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Copz2Q9JHH9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copz2Q9JHH9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copz2Q9JHH9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copz2Q9JHH9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copz2Q9JHH9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copz2Q9JHH9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copz2Q9JHH9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copz2Q9JHH9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copz2Q9JHH9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copz2Q9JHH9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Copz2Q9JHH9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copz2Q9JHH9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copz2Q9JHH9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copz2Q9JHH9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Copz2Q9JHH9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Copz2Q9JHH9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copz2Q9JHH9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copz2Q9JHH9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copz2Q9JHH9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Copz2Q9JHH9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copz2Q9JHH9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copz2Q9JHH9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copz2Q9JHH9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copz2Q9JHH9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copz2Q9JHH9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copz2Q9JHH9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copz2Q9JHH9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copz2Q9JHH9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copz2Q9JHH9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Copz2Q9JHH9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Copz2Q9JHH9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copz2Q9JHH9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Copz2Q9JHH9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copz2Q9JHH9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copz2Q9JHH9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copz2Q9JHH9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copz2Q9JHH9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copz2Q9JHH9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copz2Q9JHH9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copz2Q9JHH9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Copz2Q9JHH9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copz2Q9JHH9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copz2Q9JHH9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Copz2Q9JHH9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copz2Q9JHH9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Copz2Q9JHH9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Copz2Q9JHH9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copz2Q9JHH9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copz2Q9JHH9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Copz2Q9JHH9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Copz2Q9JHH9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Copz2Q9JHH9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Copz2Q9JHH9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Copz2Q9JHH9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copz2Q9JHH9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Copz2Q9JHH9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copz2Q9JHH9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copz2Q9JHH9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copz2Q9JHH9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copz2Q9JHH9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copz2Q9JHH9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copz2Q9JHH9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copz2Q9JHH9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copz2Q9JHH9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copz2Q9JHH9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copz2Q9JHH9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copz2Q9JHH9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copz2Q9JHH9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copz2Q9JHH9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms