Protein–RNA interactions for Protein: Q9EST1

Gsdma, Gasdermin-A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmaQ9EST1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
GsdmaQ9EST1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
GsdmaQ9EST1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GsdmaQ9EST1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37■■■■□ 3.51
GsdmaQ9EST1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
GsdmaQ9EST1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GsdmaQ9EST1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GsdmaQ9EST1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GsdmaQ9EST1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GsdmaQ9EST1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GsdmaQ9EST1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GsdmaQ9EST1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GsdmaQ9EST1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GsdmaQ9EST1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GsdmaQ9EST1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GsdmaQ9EST1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GsdmaQ9EST1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GsdmaQ9EST1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GsdmaQ9EST1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GsdmaQ9EST1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GsdmaQ9EST1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GsdmaQ9EST1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
GsdmaQ9EST1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GsdmaQ9EST1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
GsdmaQ9EST1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GsdmaQ9EST1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
GsdmaQ9EST1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GsdmaQ9EST1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GsdmaQ9EST1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
GsdmaQ9EST1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GsdmaQ9EST1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GsdmaQ9EST1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
GsdmaQ9EST1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
GsdmaQ9EST1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GsdmaQ9EST1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
GsdmaQ9EST1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
GsdmaQ9EST1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GsdmaQ9EST1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GsdmaQ9EST1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GsdmaQ9EST1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
GsdmaQ9EST1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
GsdmaQ9EST1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GsdmaQ9EST1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GsdmaQ9EST1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GsdmaQ9EST1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GsdmaQ9EST1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GsdmaQ9EST1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GsdmaQ9EST1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GsdmaQ9EST1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
GsdmaQ9EST1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
GsdmaQ9EST1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GsdmaQ9EST1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GsdmaQ9EST1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GsdmaQ9EST1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GsdmaQ9EST1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GsdmaQ9EST1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GsdmaQ9EST1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GsdmaQ9EST1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GsdmaQ9EST1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GsdmaQ9EST1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GsdmaQ9EST1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GsdmaQ9EST1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GsdmaQ9EST1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GsdmaQ9EST1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
GsdmaQ9EST1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GsdmaQ9EST1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GsdmaQ9EST1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GsdmaQ9EST1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GsdmaQ9EST1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GsdmaQ9EST1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GsdmaQ9EST1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GsdmaQ9EST1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
GsdmaQ9EST1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GsdmaQ9EST1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GsdmaQ9EST1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
GsdmaQ9EST1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GsdmaQ9EST1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GsdmaQ9EST1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
GsdmaQ9EST1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GsdmaQ9EST1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GsdmaQ9EST1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
GsdmaQ9EST1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GsdmaQ9EST1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GsdmaQ9EST1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GsdmaQ9EST1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GsdmaQ9EST1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GsdmaQ9EST1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GsdmaQ9EST1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GsdmaQ9EST1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GsdmaQ9EST1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GsdmaQ9EST1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GsdmaQ9EST1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GsdmaQ9EST1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms