Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24,19■■□□□ 1,46
DysfQ9ESD7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
DysfQ9ESD7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
DysfQ9ESD7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,46
DysfQ9ESD7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
DysfQ9ESD7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
DysfQ9ESD7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
DysfQ9ESD7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
DysfQ9ESD7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
DysfQ9ESD7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
DysfQ9ESD7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
DysfQ9ESD7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
DysfQ9ESD7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24,03■■□□□ 1,44
DysfQ9ESD7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
DysfQ9ESD7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
DysfQ9ESD7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
DysfQ9ESD7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
DysfQ9ESD7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
DysfQ9ESD7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
DysfQ9ESD7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
DysfQ9ESD7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
DysfQ9ESD7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
DysfQ9ESD7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
DysfQ9ESD7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
DysfQ9ESD7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
DysfQ9ESD7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
DysfQ9ESD7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
DysfQ9ESD7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
DysfQ9ESD7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
DysfQ9ESD7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
DysfQ9ESD7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
DysfQ9ESD7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
DysfQ9ESD7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
DysfQ9ESD7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
DysfQ9ESD7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
DysfQ9ESD7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
DysfQ9ESD7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
DysfQ9ESD7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
DysfQ9ESD7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
DysfQ9ESD7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
DysfQ9ESD7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,35
DysfQ9ESD7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
DysfQ9ESD7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
DysfQ9ESD7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
DysfQ9ESD7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
DysfQ9ESD7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
DysfQ9ESD7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
DysfQ9ESD7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23,44■■□□□ 1,34
DysfQ9ESD7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
DysfQ9ESD7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
DysfQ9ESD7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
DysfQ9ESD7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,4■■□□□ 1,34
DysfQ9ESD7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
DysfQ9ESD7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
DysfQ9ESD7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
DysfQ9ESD7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
DysfQ9ESD7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
DysfQ9ESD7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
DysfQ9ESD7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
DysfQ9ESD7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
DysfQ9ESD7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
DysfQ9ESD7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
DysfQ9ESD7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
DysfQ9ESD7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
DysfQ9ESD7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23,21■■□□□ 1,31
DysfQ9ESD7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
DysfQ9ESD7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
DysfQ9ESD7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
DysfQ9ESD7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
DysfQ9ESD7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
DysfQ9ESD7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
DysfQ9ESD7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
DysfQ9ESD7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
DysfQ9ESD7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,13■■□□□ 1,29
DysfQ9ESD7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
DysfQ9ESD7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
DysfQ9ESD7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
DysfQ9ESD7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
DysfQ9ESD7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
DysfQ9ESD7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
DysfQ9ESD7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23,06■■□□□ 1,28
DysfQ9ESD7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,06■■□□□ 1,28
DysfQ9ESD7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,05■■□□□ 1,28
DysfQ9ESD7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
DysfQ9ESD7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
DysfQ9ESD7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
DysfQ9ESD7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
DysfQ9ESD7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
DysfQ9ESD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
DysfQ9ESD7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
DysfQ9ESD7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
DysfQ9ESD7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,93■■□□□ 1,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,8 ms