Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES00

Ube4b, Ubiquitin conjugation factor E4 B, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube4bQ9ES00 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube4bQ9ES00 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube4bQ9ES00 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube4bQ9ES00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube4bQ9ES00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube4bQ9ES00 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube4bQ9ES00 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube4bQ9ES00 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube4bQ9ES00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ube4bQ9ES00 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube4bQ9ES00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4bQ9ES00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube4bQ9ES00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube4bQ9ES00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube4bQ9ES00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ube4bQ9ES00 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube4bQ9ES00 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube4bQ9ES00 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube4bQ9ES00 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube4bQ9ES00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube4bQ9ES00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube4bQ9ES00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ube4bQ9ES00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ube4bQ9ES00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ube4bQ9ES00 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ube4bQ9ES00 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ube4bQ9ES00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ube4bQ9ES00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ube4bQ9ES00 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube4bQ9ES00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube4bQ9ES00 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ube4bQ9ES00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ube4bQ9ES00 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ube4bQ9ES00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ube4bQ9ES00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ube4bQ9ES00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ube4bQ9ES00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube4bQ9ES00 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ube4bQ9ES00 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube4bQ9ES00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ube4bQ9ES00 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ube4bQ9ES00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ube4bQ9ES00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube4bQ9ES00 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube4bQ9ES00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube4bQ9ES00 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube4bQ9ES00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube4bQ9ES00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube4bQ9ES00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube4bQ9ES00 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube4bQ9ES00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube4bQ9ES00 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube4bQ9ES00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube4bQ9ES00 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube4bQ9ES00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube4bQ9ES00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube4bQ9ES00 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube4bQ9ES00 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube4bQ9ES00 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube4bQ9ES00 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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