Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lima1Q9ERG0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lima1Q9ERG0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lima1Q9ERG0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lima1Q9ERG0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lima1Q9ERG0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lima1Q9ERG0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lima1Q9ERG0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lima1Q9ERG0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lima1Q9ERG0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lima1Q9ERG0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lima1Q9ERG0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lima1Q9ERG0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lima1Q9ERG0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lima1Q9ERG0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lima1Q9ERG0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lima1Q9ERG0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lima1Q9ERG0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lima1Q9ERG0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lima1Q9ERG0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lima1Q9ERG0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lima1Q9ERG0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lima1Q9ERG0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lima1Q9ERG0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lima1Q9ERG0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lima1Q9ERG0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lima1Q9ERG0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lima1Q9ERG0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lima1Q9ERG0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lima1Q9ERG0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lima1Q9ERG0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lima1Q9ERG0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lima1Q9ERG0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lima1Q9ERG0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lima1Q9ERG0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lima1Q9ERG0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lima1Q9ERG0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lima1Q9ERG0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lima1Q9ERG0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lima1Q9ERG0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lima1Q9ERG0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lima1Q9ERG0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lima1Q9ERG0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lima1Q9ERG0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lima1Q9ERG0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lima1Q9ERG0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lima1Q9ERG0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lima1Q9ERG0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lima1Q9ERG0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lima1Q9ERG0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lima1Q9ERG0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lima1Q9ERG0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lima1Q9ERG0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lima1Q9ERG0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lima1Q9ERG0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lima1Q9ERG0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lima1Q9ERG0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lima1Q9ERG0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lima1Q9ERG0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms