Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Capn12Q9ER56 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Capn12Q9ER56 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Capn12Q9ER56 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Capn12Q9ER56 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Capn12Q9ER56 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Capn12Q9ER56 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Capn12Q9ER56 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Capn12Q9ER56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Capn12Q9ER56 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Capn12Q9ER56 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Capn12Q9ER56 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Capn12Q9ER56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Capn12Q9ER56 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Capn12Q9ER56 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Capn12Q9ER56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Capn12Q9ER56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Capn12Q9ER56 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Capn12Q9ER56 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Capn12Q9ER56 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Capn12Q9ER56 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Capn12Q9ER56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn12Q9ER56 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Capn12Q9ER56 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Capn12Q9ER56 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Capn12Q9ER56 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capn12Q9ER56 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capn12Q9ER56 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Capn12Q9ER56 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Capn12Q9ER56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capn12Q9ER56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Capn12Q9ER56 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Capn12Q9ER56 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Capn12Q9ER56 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Capn12Q9ER56 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Capn12Q9ER56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Capn12Q9ER56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn12Q9ER56 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Capn12Q9ER56 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Capn12Q9ER56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Capn12Q9ER56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Capn12Q9ER56 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Capn12Q9ER56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Capn12Q9ER56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Capn12Q9ER56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Capn12Q9ER56 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Capn12Q9ER56 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Capn12Q9ER56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Capn12Q9ER56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Capn12Q9ER56 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Capn12Q9ER56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Capn12Q9ER56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Capn12Q9ER56 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Capn12Q9ER56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Capn12Q9ER56 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capn12Q9ER56 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn12Q9ER56 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn12Q9ER56 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Capn12Q9ER56 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Capn12Q9ER56 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capn12Q9ER56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Capn12Q9ER56 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn12Q9ER56 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn12Q9ER56 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Capn12Q9ER56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Capn12Q9ER56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Capn12Q9ER56 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn12Q9ER56 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Capn12Q9ER56 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Capn12Q9ER56 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Capn12Q9ER56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Capn12Q9ER56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn12Q9ER56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Capn12Q9ER56 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn12Q9ER56 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn12Q9ER56 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn12Q9ER56 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn12Q9ER56 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn12Q9ER56 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Capn12Q9ER56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Capn12Q9ER56 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn12Q9ER56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Capn12Q9ER56 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Capn12Q9ER56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn12Q9ER56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn12Q9ER56 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn12Q9ER56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Capn12Q9ER56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Capn12Q9ER56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Capn12Q9ER56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Capn12Q9ER56 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Capn12Q9ER56 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Capn12Q9ER56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn12Q9ER56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn12Q9ER56 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Capn12Q9ER56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Capn12Q9ER56 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capn12Q9ER56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Capn12Q9ER56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Capn12Q9ER56 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms