Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tor1aQ9ER39 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tor1aQ9ER39 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tor1aQ9ER39 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tor1aQ9ER39 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tor1aQ9ER39 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tor1aQ9ER39 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tor1aQ9ER39 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tor1aQ9ER39 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tor1aQ9ER39 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tor1aQ9ER39 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tor1aQ9ER39 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tor1aQ9ER39 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tor1aQ9ER39 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tor1aQ9ER39 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tor1aQ9ER39 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tor1aQ9ER39 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tor1aQ9ER39 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tor1aQ9ER39 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tor1aQ9ER39 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tor1aQ9ER39 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tor1aQ9ER39 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1aQ9ER39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1aQ9ER39 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1aQ9ER39 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tor1aQ9ER39 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tor1aQ9ER39 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tor1aQ9ER39 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tor1aQ9ER39 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tor1aQ9ER39 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tor1aQ9ER39 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tor1aQ9ER39 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tor1aQ9ER39 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tor1aQ9ER39 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tor1aQ9ER39 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tor1aQ9ER39 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tor1aQ9ER39 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tor1aQ9ER39 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tor1aQ9ER39 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tor1aQ9ER39 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tor1aQ9ER39 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tor1aQ9ER39 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tor1aQ9ER39 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tor1aQ9ER39 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tor1aQ9ER39 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tor1aQ9ER39 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tor1aQ9ER39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tor1aQ9ER39 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tor1aQ9ER39 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tor1aQ9ER39 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tor1aQ9ER39 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tor1aQ9ER39 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tor1aQ9ER39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tor1aQ9ER39 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tor1aQ9ER39 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tor1aQ9ER39 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tor1aQ9ER39 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tor1aQ9ER39 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tor1aQ9ER39 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tor1aQ9ER39 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tor1aQ9ER39 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tor1aQ9ER39 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tor1aQ9ER39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tor1aQ9ER39 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tor1aQ9ER39 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tor1aQ9ER39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tor1aQ9ER39 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tor1aQ9ER39 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tor1aQ9ER39 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tor1aQ9ER39 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tor1aQ9ER39 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tor1aQ9ER39 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tor1aQ9ER39 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tor1aQ9ER39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tor1aQ9ER39 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tor1aQ9ER39 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tor1aQ9ER39 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tor1aQ9ER39 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tor1aQ9ER39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tor1aQ9ER39 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tor1aQ9ER39 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tor1aQ9ER39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tor1aQ9ER39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tor1aQ9ER39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tor1aQ9ER39 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms