Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Yipf5Q9EQQ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Yipf5Q9EQQ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Yipf5Q9EQQ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Yipf5Q9EQQ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Yipf5Q9EQQ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Yipf5Q9EQQ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Yipf5Q9EQQ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Yipf5Q9EQQ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Yipf5Q9EQQ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Yipf5Q9EQQ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Yipf5Q9EQQ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Yipf5Q9EQQ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Yipf5Q9EQQ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf5Q9EQQ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf5Q9EQQ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf5Q9EQQ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yipf5Q9EQQ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf5Q9EQQ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yipf5Q9EQQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yipf5Q9EQQ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yipf5Q9EQQ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yipf5Q9EQQ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Yipf5Q9EQQ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Yipf5Q9EQQ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Yipf5Q9EQQ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Yipf5Q9EQQ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Yipf5Q9EQQ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Yipf5Q9EQQ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Yipf5Q9EQQ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Yipf5Q9EQQ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Yipf5Q9EQQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Yipf5Q9EQQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Yipf5Q9EQQ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Yipf5Q9EQQ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Yipf5Q9EQQ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yipf5Q9EQQ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Yipf5Q9EQQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Yipf5Q9EQQ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Yipf5Q9EQQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Yipf5Q9EQQ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yipf5Q9EQQ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yipf5Q9EQQ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yipf5Q9EQQ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yipf5Q9EQQ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Yipf5Q9EQQ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Yipf5Q9EQQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Yipf5Q9EQQ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Yipf5Q9EQQ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Yipf5Q9EQQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Yipf5Q9EQQ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Yipf5Q9EQQ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Yipf5Q9EQQ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Yipf5Q9EQQ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Yipf5Q9EQQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Yipf5Q9EQQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yipf5Q9EQQ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yipf5Q9EQQ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yipf5Q9EQQ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yipf5Q9EQQ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Yipf5Q9EQQ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yipf5Q9EQQ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yipf5Q9EQQ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yipf5Q9EQQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Yipf5Q9EQQ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yipf5Q9EQQ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yipf5Q9EQQ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yipf5Q9EQQ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Yipf5Q9EQQ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf5Q9EQQ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yipf5Q9EQQ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Yipf5Q9EQQ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yipf5Q9EQQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yipf5Q9EQQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yipf5Q9EQQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yipf5Q9EQQ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Yipf5Q9EQQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yipf5Q9EQQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Yipf5Q9EQQ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Yipf5Q9EQQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Yipf5Q9EQQ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Yipf5Q9EQQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Yipf5Q9EQQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Yipf5Q9EQQ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Yipf5Q9EQQ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms