Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD24

Tceal9, Transcription elongation factor A protein-like 9, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal9Q9DD24 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tceal9Q9DD24 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Tceal9Q9DD24 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Tceal9Q9DD24 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Tceal9Q9DD24 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tceal9Q9DD24 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tceal9Q9DD24 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tceal9Q9DD24 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Tceal9Q9DD24 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Tceal9Q9DD24 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Tceal9Q9DD24 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tceal9Q9DD24 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Tceal9Q9DD24 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tceal9Q9DD24 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tceal9Q9DD24 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Tceal9Q9DD24 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tceal9Q9DD24 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tceal9Q9DD24 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tceal9Q9DD24 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Tceal9Q9DD24 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tceal9Q9DD24 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tceal9Q9DD24 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tceal9Q9DD24 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Tceal9Q9DD24 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tceal9Q9DD24 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tceal9Q9DD24 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Tceal9Q9DD24 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tceal9Q9DD24 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tceal9Q9DD24 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Tceal9Q9DD24 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tceal9Q9DD24 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tceal9Q9DD24 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tceal9Q9DD24 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tceal9Q9DD24 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tceal9Q9DD24 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Tceal9Q9DD24 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Tceal9Q9DD24 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Tceal9Q9DD24 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Tceal9Q9DD24 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Tceal9Q9DD24 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tceal9Q9DD24 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Tceal9Q9DD24 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Tceal9Q9DD24 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Tceal9Q9DD24 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Tceal9Q9DD24 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Tceal9Q9DD24 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Tceal9Q9DD24 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Tceal9Q9DD24 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Tceal9Q9DD24 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Tceal9Q9DD24 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tceal9Q9DD24 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tceal9Q9DD24 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tceal9Q9DD24 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Tceal9Q9DD24 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Tceal9Q9DD24 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tceal9Q9DD24 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Tceal9Q9DD24 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tceal9Q9DD24 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tceal9Q9DD24 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tceal9Q9DD24 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tceal9Q9DD24 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Tceal9Q9DD24 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tceal9Q9DD24 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Tceal9Q9DD24 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Tceal9Q9DD24 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Tceal9Q9DD24 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Tceal9Q9DD24 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tceal9Q9DD24 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Tceal9Q9DD24 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tceal9Q9DD24 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tceal9Q9DD24 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tceal9Q9DD24 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tceal9Q9DD24 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Tceal9Q9DD24 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Tceal9Q9DD24 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tceal9Q9DD24 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tceal9Q9DD24 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tceal9Q9DD24 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tceal9Q9DD24 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tceal9Q9DD24 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tceal9Q9DD24 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Tceal9Q9DD24 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tceal9Q9DD24 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tceal9Q9DD24 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tceal9Q9DD24 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tceal9Q9DD24 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tceal9Q9DD24 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tceal9Q9DD24 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tceal9Q9DD24 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Tceal9Q9DD24 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tceal9Q9DD24 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Tceal9Q9DD24 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Tceal9Q9DD24 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms