Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tomm20Q9DCC8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tomm20Q9DCC8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tomm20Q9DCC8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tomm20Q9DCC8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tomm20Q9DCC8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tomm20Q9DCC8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tomm20Q9DCC8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tomm20Q9DCC8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tomm20Q9DCC8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tomm20Q9DCC8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tomm20Q9DCC8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tomm20Q9DCC8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tomm20Q9DCC8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tomm20Q9DCC8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tomm20Q9DCC8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tomm20Q9DCC8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tomm20Q9DCC8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tomm20Q9DCC8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tomm20Q9DCC8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tomm20Q9DCC8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tomm20Q9DCC8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tomm20Q9DCC8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tomm20Q9DCC8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tomm20Q9DCC8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tomm20Q9DCC8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tomm20Q9DCC8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tomm20Q9DCC8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tomm20Q9DCC8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tomm20Q9DCC8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tomm20Q9DCC8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tomm20Q9DCC8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tomm20Q9DCC8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tomm20Q9DCC8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tomm20Q9DCC8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tomm20Q9DCC8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tomm20Q9DCC8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tomm20Q9DCC8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tomm20Q9DCC8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tomm20Q9DCC8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tomm20Q9DCC8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tomm20Q9DCC8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tomm20Q9DCC8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tomm20Q9DCC8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tomm20Q9DCC8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tomm20Q9DCC8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tomm20Q9DCC8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tomm20Q9DCC8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tomm20Q9DCC8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tomm20Q9DCC8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tomm20Q9DCC8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tomm20Q9DCC8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tomm20Q9DCC8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tomm20Q9DCC8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tomm20Q9DCC8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tomm20Q9DCC8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tomm20Q9DCC8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tomm20Q9DCC8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tomm20Q9DCC8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tomm20Q9DCC8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tomm20Q9DCC8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tomm20Q9DCC8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tomm20Q9DCC8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tomm20Q9DCC8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tomm20Q9DCC8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tomm20Q9DCC8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tomm20Q9DCC8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tomm20Q9DCC8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tomm20Q9DCC8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tomm20Q9DCC8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tomm20Q9DCC8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tomm20Q9DCC8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tomm20Q9DCC8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tomm20Q9DCC8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tomm20Q9DCC8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tomm20Q9DCC8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tomm20Q9DCC8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tomm20Q9DCC8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tomm20Q9DCC8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tomm20Q9DCC8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tomm20Q9DCC8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tomm20Q9DCC8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tomm20Q9DCC8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tomm20Q9DCC8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tomm20Q9DCC8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms