Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20aQ9DC33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20aQ9DC33 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20aQ9DC33 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmg20aQ9DC33 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20aQ9DC33 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmg20aQ9DC33 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20aQ9DC33 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmg20aQ9DC33 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20aQ9DC33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20aQ9DC33 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20aQ9DC33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20aQ9DC33 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmg20aQ9DC33 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmg20aQ9DC33 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hmg20aQ9DC33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmg20aQ9DC33 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmg20aQ9DC33 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmg20aQ9DC33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmg20aQ9DC33 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmg20aQ9DC33 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20aQ9DC33 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20aQ9DC33 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmg20aQ9DC33 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmg20aQ9DC33 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20aQ9DC33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20aQ9DC33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20aQ9DC33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20aQ9DC33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20aQ9DC33 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20aQ9DC33 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmg20aQ9DC33 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20aQ9DC33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmg20aQ9DC33 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmg20aQ9DC33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20aQ9DC33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20aQ9DC33 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmg20aQ9DC33 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20aQ9DC33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmg20aQ9DC33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmg20aQ9DC33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmg20aQ9DC33 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20aQ9DC33 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmg20aQ9DC33 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmg20aQ9DC33 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20aQ9DC33 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmg20aQ9DC33 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmg20aQ9DC33 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20aQ9DC33 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20aQ9DC33 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmg20aQ9DC33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmg20aQ9DC33 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20aQ9DC33 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmg20aQ9DC33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20aQ9DC33 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20aQ9DC33 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmg20aQ9DC33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20aQ9DC33 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20aQ9DC33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hmg20aQ9DC33 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmg20aQ9DC33 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmg20aQ9DC33 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hmg20aQ9DC33 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hmg20aQ9DC33 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmg20aQ9DC33 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hmg20aQ9DC33 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmg20aQ9DC33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms