Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apbb2Q9DBR4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Apbb2Q9DBR4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apbb2Q9DBR4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb2Q9DBR4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb2Q9DBR4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apbb2Q9DBR4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apbb2Q9DBR4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apbb2Q9DBR4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apbb2Q9DBR4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apbb2Q9DBR4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apbb2Q9DBR4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apbb2Q9DBR4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apbb2Q9DBR4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apbb2Q9DBR4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb2Q9DBR4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Apbb2Q9DBR4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apbb2Q9DBR4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apbb2Q9DBR4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apbb2Q9DBR4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apbb2Q9DBR4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apbb2Q9DBR4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Apbb2Q9DBR4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apbb2Q9DBR4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apbb2Q9DBR4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Apbb2Q9DBR4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apbb2Q9DBR4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apbb2Q9DBR4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apbb2Q9DBR4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apbb2Q9DBR4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apbb2Q9DBR4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apbb2Q9DBR4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apbb2Q9DBR4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Apbb2Q9DBR4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Apbb2Q9DBR4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apbb2Q9DBR4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Apbb2Q9DBR4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apbb2Q9DBR4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb2Q9DBR4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apbb2Q9DBR4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apbb2Q9DBR4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apbb2Q9DBR4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb2Q9DBR4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb2Q9DBR4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Apbb2Q9DBR4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apbb2Q9DBR4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb2Q9DBR4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb2Q9DBR4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb2Q9DBR4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apbb2Q9DBR4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apbb2Q9DBR4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apbb2Q9DBR4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apbb2Q9DBR4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apbb2Q9DBR4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apbb2Q9DBR4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Apbb2Q9DBR4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apbb2Q9DBR4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apbb2Q9DBR4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apbb2Q9DBR4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Apbb2Q9DBR4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apbb2Q9DBR4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb2Q9DBR4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apbb2Q9DBR4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apbb2Q9DBR4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb2Q9DBR4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apbb2Q9DBR4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apbb2Q9DBR4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Apbb2Q9DBR4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb2Q9DBR4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb2Q9DBR4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apbb2Q9DBR4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apbb2Q9DBR4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apbb2Q9DBR4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb2Q9DBR4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb2Q9DBR4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apbb2Q9DBR4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apbb2Q9DBR4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb2Q9DBR4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apbb2Q9DBR4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms