Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smim23Q9DAL0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smim23Q9DAL0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smim23Q9DAL0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smim23Q9DAL0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smim23Q9DAL0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smim23Q9DAL0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smim23Q9DAL0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smim23Q9DAL0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smim23Q9DAL0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Smim23Q9DAL0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smim23Q9DAL0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smim23Q9DAL0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smim23Q9DAL0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smim23Q9DAL0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smim23Q9DAL0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smim23Q9DAL0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smim23Q9DAL0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smim23Q9DAL0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smim23Q9DAL0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smim23Q9DAL0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smim23Q9DAL0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smim23Q9DAL0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smim23Q9DAL0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smim23Q9DAL0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smim23Q9DAL0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smim23Q9DAL0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smim23Q9DAL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smim23Q9DAL0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smim23Q9DAL0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smim23Q9DAL0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smim23Q9DAL0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smim23Q9DAL0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smim23Q9DAL0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smim23Q9DAL0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smim23Q9DAL0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smim23Q9DAL0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smim23Q9DAL0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smim23Q9DAL0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smim23Q9DAL0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smim23Q9DAL0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smim23Q9DAL0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smim23Q9DAL0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smim23Q9DAL0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smim23Q9DAL0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smim23Q9DAL0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smim23Q9DAL0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim23Q9DAL0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smim23Q9DAL0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smim23Q9DAL0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smim23Q9DAL0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smim23Q9DAL0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smim23Q9DAL0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim23Q9DAL0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smim23Q9DAL0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smim23Q9DAL0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim23Q9DAL0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim23Q9DAL0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smim23Q9DAL0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smim23Q9DAL0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smim23Q9DAL0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smim23Q9DAL0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smim23Q9DAL0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smim23Q9DAL0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smim23Q9DAL0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smim23Q9DAL0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smim23Q9DAL0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smim23Q9DAL0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smim23Q9DAL0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Smim23Q9DAL0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms