Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9K8

Iqcf1, IQ domain-containing protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf1Q9D9K8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Iqcf1Q9D9K8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Iqcf1Q9D9K8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Iqcf1Q9D9K8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Iqcf1Q9D9K8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Iqcf1Q9D9K8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Iqcf1Q9D9K8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Iqcf1Q9D9K8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Iqcf1Q9D9K8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Iqcf1Q9D9K8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Iqcf1Q9D9K8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Iqcf1Q9D9K8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Iqcf1Q9D9K8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Iqcf1Q9D9K8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Iqcf1Q9D9K8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Iqcf1Q9D9K8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Iqcf1Q9D9K8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Iqcf1Q9D9K8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Iqcf1Q9D9K8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Iqcf1Q9D9K8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Iqcf1Q9D9K8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Iqcf1Q9D9K8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Iqcf1Q9D9K8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Iqcf1Q9D9K8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Iqcf1Q9D9K8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Iqcf1Q9D9K8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Iqcf1Q9D9K8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Iqcf1Q9D9K8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Iqcf1Q9D9K8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Iqcf1Q9D9K8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Iqcf1Q9D9K8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Iqcf1Q9D9K8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Iqcf1Q9D9K8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Iqcf1Q9D9K8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Iqcf1Q9D9K8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Iqcf1Q9D9K8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Iqcf1Q9D9K8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Iqcf1Q9D9K8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Iqcf1Q9D9K8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Iqcf1Q9D9K8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Iqcf1Q9D9K8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Iqcf1Q9D9K8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Iqcf1Q9D9K8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Iqcf1Q9D9K8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Iqcf1Q9D9K8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Iqcf1Q9D9K8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Iqcf1Q9D9K8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Iqcf1Q9D9K8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Iqcf1Q9D9K8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Iqcf1Q9D9K8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Iqcf1Q9D9K8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Iqcf1Q9D9K8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Iqcf1Q9D9K8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Iqcf1Q9D9K8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Iqcf1Q9D9K8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Iqcf1Q9D9K8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Iqcf1Q9D9K8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Iqcf1Q9D9K8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Iqcf1Q9D9K8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Iqcf1Q9D9K8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Iqcf1Q9D9K8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Iqcf1Q9D9K8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Iqcf1Q9D9K8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Iqcf1Q9D9K8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Iqcf1Q9D9K8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Iqcf1Q9D9K8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Iqcf1Q9D9K8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Iqcf1Q9D9K8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Iqcf1Q9D9K8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Iqcf1Q9D9K8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Iqcf1Q9D9K8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Iqcf1Q9D9K8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Iqcf1Q9D9K8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Iqcf1Q9D9K8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Iqcf1Q9D9K8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Iqcf1Q9D9K8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Iqcf1Q9D9K8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Iqcf1Q9D9K8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Iqcf1Q9D9K8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Iqcf1Q9D9K8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Iqcf1Q9D9K8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Iqcf1Q9D9K8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Iqcf1Q9D9K8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Iqcf1Q9D9K8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Iqcf1Q9D9K8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Iqcf1Q9D9K8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Iqcf1Q9D9K8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Iqcf1Q9D9K8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Iqcf1Q9D9K8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Iqcf1Q9D9K8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,6 ms