Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntd1Q9D995 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cntd1Q9D995 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cntd1Q9D995 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cntd1Q9D995 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntd1Q9D995 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntd1Q9D995 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntd1Q9D995 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntd1Q9D995 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntd1Q9D995 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntd1Q9D995 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cntd1Q9D995 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntd1Q9D995 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntd1Q9D995 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cntd1Q9D995 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cntd1Q9D995 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cntd1Q9D995 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cntd1Q9D995 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntd1Q9D995 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntd1Q9D995 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntd1Q9D995 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntd1Q9D995 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntd1Q9D995 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntd1Q9D995 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntd1Q9D995 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntd1Q9D995 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntd1Q9D995 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntd1Q9D995 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntd1Q9D995 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntd1Q9D995 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntd1Q9D995 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntd1Q9D995 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntd1Q9D995 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntd1Q9D995 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntd1Q9D995 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntd1Q9D995 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntd1Q9D995 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntd1Q9D995 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntd1Q9D995 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntd1Q9D995 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntd1Q9D995 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntd1Q9D995 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntd1Q9D995 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntd1Q9D995 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntd1Q9D995 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntd1Q9D995 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntd1Q9D995 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntd1Q9D995 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntd1Q9D995 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntd1Q9D995 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntd1Q9D995 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntd1Q9D995 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntd1Q9D995 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntd1Q9D995 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cntd1Q9D995 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntd1Q9D995 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntd1Q9D995 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntd1Q9D995 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntd1Q9D995 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntd1Q9D995 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntd1Q9D995 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntd1Q9D995 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntd1Q9D995 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntd1Q9D995 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntd1Q9D995 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntd1Q9D995 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cntd1Q9D995 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cntd1Q9D995 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cntd1Q9D995 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntd1Q9D995 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cntd1Q9D995 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cntd1Q9D995 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cntd1Q9D995 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntd1Q9D995 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cntd1Q9D995 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cntd1Q9D995 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cntd1Q9D995 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntd1Q9D995 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cntd1Q9D995 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cntd1Q9D995 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms