Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Ccdc91Q9D8L5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Ccdc91Q9D8L5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Ccdc91Q9D8L5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Ccdc91Q9D8L5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Ccdc91Q9D8L5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ccdc91Q9D8L5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ccdc91Q9D8L5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ccdc91Q9D8L5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ccdc91Q9D8L5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccdc91Q9D8L5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Ccdc91Q9D8L5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ccdc91Q9D8L5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ccdc91Q9D8L5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Ccdc91Q9D8L5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Ccdc91Q9D8L5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ccdc91Q9D8L5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Ccdc91Q9D8L5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,2
Ccdc91Q9D8L5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Ccdc91Q9D8L5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc91Q9D8L5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc91Q9D8L5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Ccdc91Q9D8L5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ccdc91Q9D8L5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ccdc91Q9D8L5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ccdc91Q9D8L5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc91Q9D8L5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc91Q9D8L5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc91Q9D8L5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc91Q9D8L5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc91Q9D8L5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc91Q9D8L5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ccdc91Q9D8L5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ccdc91Q9D8L5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ccdc91Q9D8L5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc91Q9D8L5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ccdc91Q9D8L5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ccdc91Q9D8L5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ccdc91Q9D8L5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ccdc91Q9D8L5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ccdc91Q9D8L5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ccdc91Q9D8L5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ccdc91Q9D8L5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Ccdc91Q9D8L5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc91Q9D8L5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc91Q9D8L5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ccdc91Q9D8L5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc91Q9D8L5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc91Q9D8L5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc91Q9D8L5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ccdc91Q9D8L5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc91Q9D8L5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc91Q9D8L5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ccdc91Q9D8L5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ccdc91Q9D8L5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ccdc91Q9D8L5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ccdc91Q9D8L5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ccdc91Q9D8L5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ccdc91Q9D8L5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ccdc91Q9D8L5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Ccdc91Q9D8L5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ccdc91Q9D8L5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ccdc91Q9D8L5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ccdc91Q9D8L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ccdc91Q9D8L5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Ccdc91Q9D8L5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ccdc91Q9D8L5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Ccdc91Q9D8L5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Ccdc91Q9D8L5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ccdc91Q9D8L5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Ccdc91Q9D8L5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ccdc91Q9D8L5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ccdc91Q9D8L5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc91Q9D8L5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc91Q9D8L5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ccdc91Q9D8L5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccdc91Q9D8L5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccdc91Q9D8L5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ccdc91Q9D8L5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Ccdc91Q9D8L5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ccdc91Q9D8L5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Ccdc91Q9D8L5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccdc91Q9D8L5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ccdc91Q9D8L5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ccdc91Q9D8L5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ccdc91Q9D8L5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ccdc91Q9D8L5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc91Q9D8L5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccdc91Q9D8L5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ccdc91Q9D8L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ccdc91Q9D8L5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ccdc91Q9D8L5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ccdc91Q9D8L5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ccdc91Q9D8L5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ccdc91Q9D8L5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ccdc91Q9D8L5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,3 ms