Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Capn9Q9D805 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Capn9Q9D805 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Capn9Q9D805 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Capn9Q9D805 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Capn9Q9D805 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Capn9Q9D805 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Capn9Q9D805 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Capn9Q9D805 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Capn9Q9D805 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Capn9Q9D805 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Capn9Q9D805 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Capn9Q9D805 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Capn9Q9D805 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Capn9Q9D805 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Capn9Q9D805 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Capn9Q9D805 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Capn9Q9D805 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Capn9Q9D805 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Capn9Q9D805 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Capn9Q9D805 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Capn9Q9D805 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Capn9Q9D805 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Capn9Q9D805 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Capn9Q9D805 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Capn9Q9D805 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Capn9Q9D805 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Capn9Q9D805 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Capn9Q9D805 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Capn9Q9D805 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Capn9Q9D805 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Capn9Q9D805 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Capn9Q9D805 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Capn9Q9D805 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Capn9Q9D805 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capn9Q9D805 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capn9Q9D805 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Capn9Q9D805 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Capn9Q9D805 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Capn9Q9D805 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Capn9Q9D805 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Capn9Q9D805 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Capn9Q9D805 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Capn9Q9D805 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Capn9Q9D805 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Capn9Q9D805 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Capn9Q9D805 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn9Q9D805 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn9Q9D805 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Capn9Q9D805 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Capn9Q9D805 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Capn9Q9D805 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Capn9Q9D805 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Capn9Q9D805 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Capn9Q9D805 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Capn9Q9D805 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Capn9Q9D805 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Capn9Q9D805 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Capn9Q9D805 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Capn9Q9D805 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Capn9Q9D805 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Capn9Q9D805 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Capn9Q9D805 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn9Q9D805 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn9Q9D805 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Capn9Q9D805 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Capn9Q9D805 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Capn9Q9D805 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn9Q9D805 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Capn9Q9D805 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Capn9Q9D805 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Capn9Q9D805 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Capn9Q9D805 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Capn9Q9D805 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Capn9Q9D805 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Capn9Q9D805 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Capn9Q9D805 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Capn9Q9D805 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Capn9Q9D805 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Capn9Q9D805 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Capn9Q9D805 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Capn9Q9D805 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Capn9Q9D805 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Capn9Q9D805 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Capn9Q9D805 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn9Q9D805 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn9Q9D805 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn9Q9D805 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Capn9Q9D805 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn9Q9D805 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Capn9Q9D805 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn9Q9D805 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms