Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Q0

Lyg1, Lysozyme g-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyg1Q9D7Q0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lyg1Q9D7Q0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lyg1Q9D7Q0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lyg1Q9D7Q0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lyg1Q9D7Q0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lyg1Q9D7Q0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lyg1Q9D7Q0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lyg1Q9D7Q0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lyg1Q9D7Q0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lyg1Q9D7Q0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lyg1Q9D7Q0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lyg1Q9D7Q0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lyg1Q9D7Q0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lyg1Q9D7Q0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lyg1Q9D7Q0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lyg1Q9D7Q0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lyg1Q9D7Q0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lyg1Q9D7Q0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lyg1Q9D7Q0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lyg1Q9D7Q0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lyg1Q9D7Q0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lyg1Q9D7Q0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lyg1Q9D7Q0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lyg1Q9D7Q0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lyg1Q9D7Q0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lyg1Q9D7Q0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lyg1Q9D7Q0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lyg1Q9D7Q0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lyg1Q9D7Q0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lyg1Q9D7Q0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lyg1Q9D7Q0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lyg1Q9D7Q0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lyg1Q9D7Q0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lyg1Q9D7Q0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lyg1Q9D7Q0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lyg1Q9D7Q0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lyg1Q9D7Q0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg1Q9D7Q0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lyg1Q9D7Q0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lyg1Q9D7Q0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lyg1Q9D7Q0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lyg1Q9D7Q0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg1Q9D7Q0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg1Q9D7Q0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg1Q9D7Q0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lyg1Q9D7Q0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lyg1Q9D7Q0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lyg1Q9D7Q0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lyg1Q9D7Q0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lyg1Q9D7Q0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lyg1Q9D7Q0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lyg1Q9D7Q0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lyg1Q9D7Q0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms