Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D727 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q9D727 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D727 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D727 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D727 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D727 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D727 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D727 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D727 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D727 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D727 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D727 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D727 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D727 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D727 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D727 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D727 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D727 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q9D727 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q9D727 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D727 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D727 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D727 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D727 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D727 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D727 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D727 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D727 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D727 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D727 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D727 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D727 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D727 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D727 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D727 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D727 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D727 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D727 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D727 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D727 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D727 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D727 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D727 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D727 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D727 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D727 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D727 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D727 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D727 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D727 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D727 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D727 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9D727 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D727 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D727 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D727 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D727 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9D727 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D727 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D727 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D727 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D727 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D727 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D727 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D727 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D727 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D727 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D727 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D727 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D727 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D727 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D727 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D727 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D727 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D727 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D727 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D727 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D727 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D727 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D727 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D727 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D727 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D727 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D727 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D727 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D727 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D727 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D727 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9D727 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D727 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D727 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D727 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D727 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D727 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D727 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D727 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D727 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D727 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D727 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms