Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp6v1e2Q9D593 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp6v1e2Q9D593 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp6v1e2Q9D593 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp6v1e2Q9D593 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp6v1e2Q9D593 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp6v1e2Q9D593 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp6v1e2Q9D593 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp6v1e2Q9D593 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp6v1e2Q9D593 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp6v1e2Q9D593 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atp6v1e2Q9D593 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atp6v1e2Q9D593 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp6v1e2Q9D593 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp6v1e2Q9D593 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp6v1e2Q9D593 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp6v1e2Q9D593 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp6v1e2Q9D593 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp6v1e2Q9D593 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp6v1e2Q9D593 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp6v1e2Q9D593 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp6v1e2Q9D593 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp6v1e2Q9D593 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp6v1e2Q9D593 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp6v1e2Q9D593 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp6v1e2Q9D593 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp6v1e2Q9D593 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp6v1e2Q9D593 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp6v1e2Q9D593 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atp6v1e2Q9D593 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp6v1e2Q9D593 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp6v1e2Q9D593 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp6v1e2Q9D593 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp6v1e2Q9D593 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp6v1e2Q9D593 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp6v1e2Q9D593 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp6v1e2Q9D593 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp6v1e2Q9D593 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp6v1e2Q9D593 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp6v1e2Q9D593 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp6v1e2Q9D593 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp6v1e2Q9D593 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp6v1e2Q9D593 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp6v1e2Q9D593 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp6v1e2Q9D593 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp6v1e2Q9D593 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp6v1e2Q9D593 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp6v1e2Q9D593 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp6v1e2Q9D593 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp6v1e2Q9D593 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp6v1e2Q9D593 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp6v1e2Q9D593 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp6v1e2Q9D593 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp6v1e2Q9D593 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp6v1e2Q9D593 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp6v1e2Q9D593 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp6v1e2Q9D593 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp6v1e2Q9D593 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp6v1e2Q9D593 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp6v1e2Q9D593 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp6v1e2Q9D593 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp6v1e2Q9D593 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp6v1e2Q9D593 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atp6v1e2Q9D593 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp6v1e2Q9D593 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp6v1e2Q9D593 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp6v1e2Q9D593 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp6v1e2Q9D593 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp6v1e2Q9D593 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp6v1e2Q9D593 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp6v1e2Q9D593 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp6v1e2Q9D593 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp6v1e2Q9D593 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp6v1e2Q9D593 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp6v1e2Q9D593 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp6v1e2Q9D593 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp6v1e2Q9D593 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp6v1e2Q9D593 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp6v1e2Q9D593 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp6v1e2Q9D593 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp6v1e2Q9D593 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp6v1e2Q9D593 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp6v1e2Q9D593 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms