Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OxsmQ9D404 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OxsmQ9D404 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OxsmQ9D404 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OxsmQ9D404 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OxsmQ9D404 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OxsmQ9D404 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OxsmQ9D404 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OxsmQ9D404 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OxsmQ9D404 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OxsmQ9D404 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OxsmQ9D404 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OxsmQ9D404 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OxsmQ9D404 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OxsmQ9D404 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OxsmQ9D404 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OxsmQ9D404 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OxsmQ9D404 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OxsmQ9D404 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OxsmQ9D404 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OxsmQ9D404 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OxsmQ9D404 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OxsmQ9D404 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OxsmQ9D404 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OxsmQ9D404 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OxsmQ9D404 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OxsmQ9D404 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OxsmQ9D404 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OxsmQ9D404 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OxsmQ9D404 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OxsmQ9D404 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OxsmQ9D404 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OxsmQ9D404 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OxsmQ9D404 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OxsmQ9D404 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OxsmQ9D404 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OxsmQ9D404 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OxsmQ9D404 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OxsmQ9D404 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OxsmQ9D404 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OxsmQ9D404 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OxsmQ9D404 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OxsmQ9D404 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OxsmQ9D404 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OxsmQ9D404 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OxsmQ9D404 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OxsmQ9D404 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OxsmQ9D404 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OxsmQ9D404 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OxsmQ9D404 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OxsmQ9D404 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OxsmQ9D404 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OxsmQ9D404 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OxsmQ9D404 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OxsmQ9D404 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OxsmQ9D404 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OxsmQ9D404 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OxsmQ9D404 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OxsmQ9D404 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OxsmQ9D404 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OxsmQ9D404 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OxsmQ9D404 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OxsmQ9D404 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OxsmQ9D404 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OxsmQ9D404 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OxsmQ9D404 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OxsmQ9D404 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OxsmQ9D404 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OxsmQ9D404 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OxsmQ9D404 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OxsmQ9D404 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OxsmQ9D404 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OxsmQ9D404 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OxsmQ9D404 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OxsmQ9D404 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OxsmQ9D404 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OxsmQ9D404 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OxsmQ9D404 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OxsmQ9D404 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OxsmQ9D404 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OxsmQ9D404 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OxsmQ9D404 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OxsmQ9D404 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OxsmQ9D404 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OxsmQ9D404 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OxsmQ9D404 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OxsmQ9D404 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OxsmQ9D404 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OxsmQ9D404 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OxsmQ9D404 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms