Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem88Q9D0N8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem88Q9D0N8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem88Q9D0N8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem88Q9D0N8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem88Q9D0N8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem88Q9D0N8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem88Q9D0N8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem88Q9D0N8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem88Q9D0N8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem88Q9D0N8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem88Q9D0N8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem88Q9D0N8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem88Q9D0N8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem88Q9D0N8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem88Q9D0N8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem88Q9D0N8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem88Q9D0N8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem88Q9D0N8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem88Q9D0N8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem88Q9D0N8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem88Q9D0N8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem88Q9D0N8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem88Q9D0N8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem88Q9D0N8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem88Q9D0N8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem88Q9D0N8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem88Q9D0N8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem88Q9D0N8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem88Q9D0N8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem88Q9D0N8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem88Q9D0N8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem88Q9D0N8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem88Q9D0N8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem88Q9D0N8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem88Q9D0N8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem88Q9D0N8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem88Q9D0N8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem88Q9D0N8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem88Q9D0N8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem88Q9D0N8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem88Q9D0N8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem88Q9D0N8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem88Q9D0N8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem88Q9D0N8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem88Q9D0N8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem88Q9D0N8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem88Q9D0N8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem88Q9D0N8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem88Q9D0N8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem88Q9D0N8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem88Q9D0N8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem88Q9D0N8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem88Q9D0N8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem88Q9D0N8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem88Q9D0N8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem88Q9D0N8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms