Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt5Q9D0C4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt5Q9D0C4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trmt5Q9D0C4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trmt5Q9D0C4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trmt5Q9D0C4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trmt5Q9D0C4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trmt5Q9D0C4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trmt5Q9D0C4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trmt5Q9D0C4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt5Q9D0C4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt5Q9D0C4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt5Q9D0C4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt5Q9D0C4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt5Q9D0C4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trmt5Q9D0C4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trmt5Q9D0C4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trmt5Q9D0C4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trmt5Q9D0C4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trmt5Q9D0C4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trmt5Q9D0C4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trmt5Q9D0C4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trmt5Q9D0C4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trmt5Q9D0C4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trmt5Q9D0C4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trmt5Q9D0C4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trmt5Q9D0C4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trmt5Q9D0C4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trmt5Q9D0C4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trmt5Q9D0C4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trmt5Q9D0C4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trmt5Q9D0C4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trmt5Q9D0C4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trmt5Q9D0C4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trmt5Q9D0C4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt5Q9D0C4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt5Q9D0C4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt5Q9D0C4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt5Q9D0C4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt5Q9D0C4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt5Q9D0C4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt5Q9D0C4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt5Q9D0C4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt5Q9D0C4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt5Q9D0C4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt5Q9D0C4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt5Q9D0C4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt5Q9D0C4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt5Q9D0C4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trmt5Q9D0C4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt5Q9D0C4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt5Q9D0C4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt5Q9D0C4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trmt5Q9D0C4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt5Q9D0C4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt5Q9D0C4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt5Q9D0C4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt5Q9D0C4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt5Q9D0C4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trmt5Q9D0C4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trmt5Q9D0C4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trmt5Q9D0C4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trmt5Q9D0C4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trmt5Q9D0C4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trmt5Q9D0C4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trmt5Q9D0C4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trmt5Q9D0C4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trmt5Q9D0C4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trmt5Q9D0C4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trmt5Q9D0C4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt5Q9D0C4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt5Q9D0C4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt5Q9D0C4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt5Q9D0C4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt5Q9D0C4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt5Q9D0C4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt5Q9D0C4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt5Q9D0C4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt5Q9D0C4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt5Q9D0C4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt5Q9D0C4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt5Q9D0C4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt5Q9D0C4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt5Q9D0C4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt5Q9D0C4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt5Q9D0C4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt5Q9D0C4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt5Q9D0C4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt5Q9D0C4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt5Q9D0C4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt5Q9D0C4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt5Q9D0C4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trmt5Q9D0C4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trmt5Q9D0C4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trmt5Q9D0C4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trmt5Q9D0C4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt5Q9D0C4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt5Q9D0C4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt5Q9D0C4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt5Q9D0C4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms